CAMTA1

CAMTA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CXK
Ідентифікатори
Символи	CAMTA1, CANPMR, calmodulin binding transcription activator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611501 MGI: 2140230 HomoloGene: 18942 GeneCards: CAMTA1
Пов'язані генетичні захворювання
nonprogressive cerebellar atxia with mental retardation
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • neuromuscular process controlling balance • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of protein dephosphorylation • positive regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23261	100072
Ensembl	ENSG00000171735	ENSMUSG00000014592
UniProt	Q9Y6Y1	A2A891
RefSeq (мРНК)	NM_001195563 NM_001242701 NM_015215	NM_001081557 NM_001166021 NM_001195565
RefSeq (білок)	NP_001182492 NP_001229630 NP_056030 NP_001336537 NP_001336538 NP_001336539 NP_001336541 NP_001336542 NP_001336543 NP_001336544 NP_001336545 NP_001336546 NP_001336547 NP_001336548 NP_001336549 NP_001336550 NP_001336551 NP_001336552 NP_001336553 NP_001336554 NP_001336555 NP_001336556	NP_001075026 NP_001182494
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 4: 150.92 – 151.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAMTA1 (англ. Calmodulin binding transcription activator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 673 амінокислот, а молекулярна маса — 183 672.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWRAEGKWLP		KTSRKSVSQS		VFCGTSTYCV		LNTVPPIEDD		HGNSNSSHVK
IFLPKKLLEC		LPKCSSLPKE		RHRWNTNEEI		AAYLITFEKH		EEWLTTSPKT
RPQNGSMILY		NRKKVKYRKD		GYCWKKRKDG		KTTREDHMKL		KVQGVECLYG
CYVHSSIIPT		FHRRCYWLLQ		NPDIVLVHYL		NVPAIEDCGK		PCGPILCSIN
TDKKEWAKWT		KEELIGQLKP		MFHGIKWTCS		NGNSSSGFSV		EQLVQQILDS
HQTKPQPRTH		NCLCTGSLGA		GGSVHHKCNS		AKHRIISPKV		EPRTGGYGSH
SEVQHNDVSE		GKHEHSHSKG		SSREKRNGKV		AKPVLLHQSS		TEVSSTNQVE
VPDTTQSSPV		SISSGLNSDP		DMVDSPVVTG		VSGMAVASVM		GSLSQSATVF
MSEVTNEAVY		TMSPTAGPNH		HLLSPDASQG		LVLAVSSDGH		KFAFPTTGSS
ESLSMLPTNV		SEELVLSTTL		DGGRKIPETT		MNFDPDCFLN		NPKQGQTYGG
GGLKAEMVSS		NIRHSPPGER		SFSFTTVLTK		EIKTEDTSFE		QQMAKEAYSS
SAAAVAASSL		TLTAGSSLLP		SGGGLSPSTT		LEQMDFSAID		SNKDYTSSFS
QTGHSPHIHQ		TPSPSFFLQD		ASKPLPVEQN		THSSLSDSGG		TFVMPTVKTE
ASSQTSSCSG		HVETRIESTS		SLHLMQFQAN		FQAMTAEGEV		TMETSQAAEG
SEVLLKSGEL		QACSSEHYLQ		PETNGVIRSA		GGVPILPGNV		VQGLYPVAQP
SLGNASNMEL		SLDHFDISFS		NQFSDLINDF		ISVEGGSSTI		YGHQLVSGDS
TALSQSEDGA		RAPFTQAEMC		LPCCSPQQGS		LQLSSSEGGA		STMAYMHVAE
VVSAASAQGT		LGMLQQSGRV		FMVTDYSPEW		SYPEGGVKVL		ITGPWQEASN
NYSCLFDQIS		VPASLIQPGV		LRCYCPAHDT		GLVTLQVAFN		NQIISNSVVF
EYKARALPTL		PSSQHDWLSL		DDNQFRMSIL		ERLEQMERRM		AEMTGSQQHK
QASGGGSSGG		GSGSGNGGSQ		AQCASGTGAL		GSCFESRVVV		VCEKMMSRAC
WAKSKHLIHS		KTFRGMTLLH		LAAAQGYATL		IQTLIKWRTK		HADSIDLELE
VDPLNVDHFS		CTPLMWACAL		GHLEAAVVLY		KWDRRAISIP		DSLGRLPLGI
ARSRGHVKLA		ECLEHLQRDE		QAQLGQNPRI		HCPASEEPST		ESWMAQWHSE
AISSPEIPKG		VTVIASTNPE		LRRPRSEPSN		YYSSESHKDY		PAPKKHKLNP
EYFQTRQEKL		LPTALSLEEP		NIRKQSPSSK		QSVPETLSPS		EGVRDFSREL
SPPTPETAAF		QASGSQPVGK		WNSKDLYIGV		STVQVTGNPK		GTSVGKEAAP
SQVRPREPMS		VLMMANREVV		NTELGSYRDS		AENEECGQPM		DDIQVNMMTL
AEHIIEATPD		RIKQENFVPM		ESSGLERTDP		ATISSTMSWL		ASYLADADCL
PSAAQIRSAY		NEPLTPSSNT		SLSPVGSPVS		EIAFEKPNLP		SAADWSEFLS
ASTSEKVENE		FAQLTLSDHE		QRELYEAARL		VQTAFRKYKG		RPLREQQEVA
AAVIQRCYRK		YKQYALYKKM		TQAAILIQSK		FRSYYEQKKF		QQSRRAAVLI
QKYYRSYKKC		GKRRQARRTA		VIVQQKLRSS		LLTKKQDQAA		RKIMRFLRRC
RHSPLVDHRL		YKRSERIEKG		QGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bouche N., Scharlat A., Snedden W., Bouchez D., Fromm H. (2002). A novel family of calmodulin-binding transcription activators in multicellular organisms. J. Biol. Chem. 277: 21851—21861. PMID 11925432 DOI:10.1074/jbc.M200268200
• Barbashina V., Salazar P., Holland E.C., Rosenblum M.K., Ladanyi M. (2005). Allelic losses at 1p36 and 19q13 in gliomas: correlation with histologic classification, definition of a 150-kb minimal deleted region on 1p36, and evaluation of CAMTA1 as a candidate tumor suppressor gene. Clin. Cancer Res. 11: 1119—1128. PMID 15709179

Див. також

• Хромосома 1