CARF

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CARF
Ідентифікатори
Символи CARF, ALS2CR8, NYD-SP24, calcium responsive transcription factor
Зовнішні ІД OMIM: 607586 MGI: 2182269 HomoloGene: 11689 GeneCards: CARF
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001285463
NM_001285473
NM_139150
RefSeq (білок)
NP_001272392
NP_001272402
NP_631889
Локус (UCSC) Хр. 2: 202.91 – 202.99 Mb Хр. 1: 60.1 – 60.15 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CARF (англ. Calcium responsive transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 725 амінокислот, а молекулярна маса — 80 698[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEQSNDSLRVNHNDGEESKTSAQVFEHLICMDSRDSSFGQNDSPTVLPIT
TREANNSLISQNIPGPLTQTQTLSAEQFHLVDQNGQAIQYELQSLGESNA
QMMIVASPTENGQVLRVIPPTQTGMAQVIIPQGQLVDVNSPRDVPEEKPS
NRNLPTVRVDTLADNTSNYILHPQTSFPLPKKSVTGMLEEPLLGPLQPLS
SNTPIWACRLRSCEKIGDSYRGYCVSETELESVLTFHKQQTQSVWGTRQS
PSPAKPATRLMWKSQYVPYDGIPFVNAGSRAVVMECQYGPRRKGFQLKKV
SEQESRSCQLYKATCPARIYIKKVQKFPEYRVPTDPKIDKKIIRMEQEKA
FNMLKKNLVDAGGVLRWYVQLPTQQAHQYHELETPCLTLSPSPFPVSSLE
EEETAVRDENCALPSRLHPQVAHKIQELVSQGIEQVYAVRKQLRKFVERE
LFKPDEVPERHNLSFFPTVNDIKNHIHEVQKSLRNGDTVYNSEIIPATLQ
WTTDSGNILKETMTVTFAEGNSPGESITTKVETNQTRGSLSPEPTHLLSS
LSSFQPKIFTQLQGLQLQPRYTSPDESPAVVSVNNQPSSSPSGLLDTIGS
AVMNNNSLLLGQSHSLQRDTCLTQNNSTASTMGNLPEPDQNLVAMDELVE
VGDVEDTGNLEGTVHRILLGDVQTIPIQIIDNHSALIEENPESTISVSQV
KQEPKEPALSMEAKKTVDYKKLSAT

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література[ред. | ред. код]

  • Tao X., West A.E., Chen W.G., Corfas G., Greenberg M.E. (2002). A calcium-responsive transcription factor, CaRF, that regulates neuronal activity-dependent expression of BDNF.. Neuron. 33: 383 — 395.  PMID 11832226 DOI:10.1016/S0896-6273(01)00561-X
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14435 (англ.). Процитовано 29 серпня 2017. 
  4. UniProt, Q8N187 (англ.). Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 29 серпня 2017. 

Див. також[ред. | ред. код]