CBX6

CBX6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3GV6, 3I90
Ідентифікатори
Символи	CBX6, chromobox 6
Зовнішні ІД	OMIM: 617438 MGI: 3512628 HomoloGene: 8619 GeneCards: CBX6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding Клітинна компонента • GO:0035328 Гетерохроматин • PcG protein complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома • клітинна мембрана • cytoplasmic side of plasma membrane • Філоподія • дендрит (нейробіологія) • growth cone • neuronal cell body Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • neuron projection development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23466	494448
Ensembl	ENSG00000183741	ENSMUSG00000089715
UniProt	O95503	Q9DBY5
RefSeq (мРНК)	NM_001303494 NM_014292	NM_028763
RefSeq (білок)	NP_001290423 NP_055107	NP_083039
Локус (UCSC)	Хр. 22: 38.86 – 38.87 Mb	Хр. 15: 79.71 – 79.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CBX6 (англ. Chromobox 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 43 898.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELSAVGERV		FAAESIIKRR		IRKGRIEYLV		KWKGWAIKYS		TWEPEENILD
SRLIAAFEQK		ERERELYGPK		KRGPKPKTFL		LKARAQAEAL		RISDVHFSVK
PSASASSPKL		HSSAAVHRLK		KDIRRCHRMS		RRPLPRPDPQ		GGSPGLRPPI
SPFSETVRII		NRKVKPREPK		RNRIILNLKV		IDKGAGGGGA		GQGAGALARP
KVPSRNRVIG		KSKKFSESVL		RTQIRHMKFG		AFALYKPPPA		PLVAPSPGKA
EASAPGPGLL		LAAPAAPYDA		RSSGSSGCPS		PTPQSSDPDD		TPPKLLPETV
SPSAPSWREP		EVLDLSLPPE		SAATSKRAPP		EVTAAAGPAP		PTAPEPAGAS
SEPEAGDWRP		EMSPCSNVVV		TDVTSNLLTV		TIKEFCNPED		FEKVAAGVAG
AAGGGGSIGA		SK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Див. також

• Хромосома 22