CCHCR1

CCHCR1
Ідентифікатори
Символи	CCHCR1, C6orf18, HCR, SBP, coiled-coil alpha-helical rod protein 1, pg8
Зовнішні ІД	OMIM: 605310 MGI: 2385321 HomoloGene: 10396 GeneCards: CCHCR1
Пов'язані генетичні захворювання
висип, рак простати, Екзантема
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • Центріоль • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • protein export from nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54535	240084
Ensembl	ENSG00000204536 ENSG00000206355 ENSG00000224180 ENSG00000206457 ENSG00000223533 ENSG00000234114	ENSMUSG00000040312
UniProt	Q8TD31	Q8K2I2
RefSeq (мРНК)	NM_001105563 NM_001105564 NM_019052 NM_001394641 NM_001394642 NM_001394643 NM_001394644 NM_001394646 NM_001394647 NM_001394648 NM_001394649 NM_001394645	NM_146248 NM_001372297 NM_001372298 NM_001372299 NM_001372300
RefSeq (білок)	NP_001099033 NP_001099034 NP_061925	NP_666360 NP_001359226 NP_001359227 NP_001359228 NP_001359229
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.14 – 31.16 Mb	Хр. 17: 35.83 – 35.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCHCR1 (англ. Coiled-coil alpha-helical rod protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 782 амінокислот, а молекулярна маса — 88 671.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFPPSGSTGL		IPPSHFQARP		LSTLPRMAPT		WLSDIPLVQP		PGHQDVSERR
LDTQRPQVTM		WERDVSSDRQ		EPGRRGRSWG		LEGSQALSQQ		AEVIVRQLQE
LRRLEEEVRL		LRETSLQQKM		RLEAQAMELE		ALARAEKAGR		AEAEGLRAAL
AGAEVVRKNL		EEGSQRELEE		VQRLHQEQLS		SLTQAHEEAL		SSLTSKAEGL
EKSLSSLETR		RAGEAKELAE		AQREAELLRK		QLSKTQEDLE		AQVTLVENLR
KYVGEQVPSE		VHSQTWELER		QKLLETMQHL		QEDRDSLHAT		AELLQVRVQS
LTHILALQEE		ELTRKVQPSD		SLEPEFTRKC		QSLLNRWREK		VFALMVQLKA
QELEHSDSVK		QLKGQVASLQ		EKVTSQSQEQ		AILQRSLQDK		AAEVEVERMG
AKGLQLELSR		AQEARRRWQQ		QTASAEEQLR		LVVNAVSSSQ		IWLETTMAKV
EGAAAQLPSL		NNRLSYAVRK		VHTIRGLIAR		KLALAQLRQE		SCPLPPPVTD
VSLELQQLRE		ERNRLDAELQ		LSARLIQQEV		GRAREQGEAE		RQQLSKVAQQ
LEQELQQTQE		SLASLGLQLE		VARQGQQEST		EEAASLRQEL		TQQQELYGQA
LQEKVAEVET		RLREQLSDTE		RRLNEARREH		AKAVVSLRQI		QRRAAQEKER
SQELRRLQEE		ARKEEGQRLA		RRLQELERDK		NLMLATLQQE		GLLSRYKQQR
LLTVLPSLLD		KKKSVVSSPR		PPECSASAPV		AAAVPTRESI		KGSLSVLLDD
LQDLSEAISK		EEAVCQGDNL		DRCSSSNPQM		SS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6