CD2BP2

CD2BP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GYF, 1L2Z, 1SYX, 4BWS
Ідентифікатори
Символи	CD2BP2, FWP010, LIN1, PPP1R59, Snu40, U5-52K, CD2 (cytoplasmic tail) binding protein 2, CD2 cytoplasmic tail binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604470 MGI: 1917483 HomoloGene: 4455 GeneCards: CD2BP2
Онтологія гена Молекулярна функція • ribonucleoprotein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • U5 snRNP • nuclear speck • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • fibrillar center • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of phosphatase activity • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • spliceosomal tri-snRNP complex assembly • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10421	70233
Ensembl	ENSG00000169217	ENSMUSG00000042502
UniProt	O95400	Q9CWK3
RefSeq (мРНК)	NM_006110 NM_001243646	NM_001285905 NM_001285906 NM_001285907 NM_027353 NM_001357817
RefSeq (білок)	NP_001230575 NP_006101 NP_001230575.1 NP_006101.1	NP_001272834 NP_001272835 NP_001272836 NP_081629 NP_001344746
Локус (UCSC)	Хр. 16: 30.35 – 30.36 Mb	Хр. 7: 126.79 – 126.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CD2BP2 (англ. CD2 cytoplasmic tail binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 37 646.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPKRKVTFQG		VGDEEDEDEI		IVPKKKLVDP		VAGSGGPGSR		FKGKHSLDSD
EEEDDDDGGS		SKYDILASED		VEGQEAATLP		SEGGVRITPF		NLQEEMEEGH
FDADGNYFLN		RDAQIRDSWL		DNIDWVKIRE		RPPGQRQASD		SEEEDSLGQT
SMSAQALLEG		LLELLLPRET		VAGALRRLGA		RGGGKGRKGP		GQPSSPQRLD
RLSGLADQMV		ARGNLGVYQE		TRERLAMRLK		GLGCQTLGPH		NPTPPPSLDM
FAEELAEEEL		ETPTPTQRGE		AESRGDGLVD		VMWEYKWENT		GDAELYGPFT
SAQMQTWVSE		GYFPDGVYCR		KLDPPGGQFY		NSKRIDFDLY		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Nishizawa K., Freund C., Li J., Wagner G., Reinherz E.L. (1998). Identification of a proline-binding motif regulating CD2-triggered T lymphocyte activation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 14897—14902. PMID 9843987 DOI:10.1073/pnas.95.25.14897
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
• Heinze M., Kofler M., Freund C. (2007). Investigating the functional role of CD2BP2 in T cells. Int. Immunol. 19: 1313—1318. PMID 17906334 DOI:10.1093/intimm/dxm100
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Freund C., Dotsch V., Nishizawa K., Reinherz E.L., Wagner G. (1999). The GYF domain is a novel structural fold that is involved in lymphoid signaling through proline-rich sequences. Nat. Struct. Biol. 6: 656—660. PMID 10404223 DOI:10.1038/10712

Див. також

• Хромосома 16