CDC40

CDC40
Ідентифікатори
Символи	CDC40, EHB3, PRP17, PRPF17, cell division cycle 40, PCH15
Зовнішні ІД	OMIM: 605585 MGI: 1918963 HomoloGene: 5716 GeneCards: CDC40
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • U2-type catalytic step 2 spliceosome • nuclear speck Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51362	71713
Ensembl	ENSG00000168438	ENSMUSG00000038446
UniProt	O60508	Q9DC48
RefSeq (мРНК)	NM_015891	NM_027879
RefSeq (білок)	NP_056975	NP_082155
Локус (UCSC)	Хр. 6: 110.18 – 110.25 Mb	Хр. 10: 40.71 – 40.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDC40 (англ. Cell division cycle 40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот, а молекулярна маса — 65 521.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAAIAALAA		SYGSGSGSES		DSDSESSRCP		LPAADSLMHL		TKSPSSKPSL
AVAVDSAPEV		AVKEDLETGV		HLDPAVKEVQ		YNPTYETMFA		PEFGPENPFR
TQQMAAPRNM		LSGYAEPAHI		NDFMFEQQRR		TFATYGYALD		PSLDNHQVSA
KYIGSVEEAE		KNQGLTVFET		GQKKTEKRKK		FKENDASNID		GFLGPWAKYV
DEKDVAKPSE		EEQKELDEIT		AKRQKKGKQE		EEKPGEEKTI		LHVKEMYDYQ
GRSYLHIPQD		VGVNLRSTMP		PEKCYLPKKQ		IHVWSGHTKG		VSAVRLFPLS
GHLLLSCSMD		CKIKLWEVYG		ERRCLRTFIG		HSKAVRDICF		NTAGTQFLSA
AYDRYLKLWD		TETGQCISRF		TNRKVPYCVK		FNPDEDKQNL		FVAGMSDKKI
VQWDIRSGEI		VQEYDRHLGA		VNTIVFVDEN		RRFVSTSDDK		SLRVWEWDIP
VDFKYIAEPS		MHSMPAVTLS		PNGKWLACQS		MDNQILIFGA		QNRFRLNKKK
IFKGHMVAGY		ACQVDFSPDM		SYVISGDGNG		KLNIWDWKTT		KLYSRFKAHD
KVCIGAVWHP		HETSKVITCG		WDGLIKLWD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Zhou Z., Reed R. (1998). Human homologs of yeast prp16 and prp17 reveal conservation of the mechanism for catalytic step II of pre-mRNA splicing. EMBO J. 17: 2095—2106. PMID 9524131 DOI:10.1093/emboj/17.7.2095
• Lindsey L.A., Garcia-Blanco M.A. (1998). Functional conservation of the human homolog of the yeast pre-mRNA splicing factor Prp17p. J. Biol. Chem. 273: 32771—32775. PMID 9830021 DOI:10.1074/jbc.273.49.32771
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 6