CELF3

CELF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DNO
Ідентифікатори
Символи	CELF3, BRUNOL1, CAGH4, ERDA4, ETR-1, TNRC4, CUGBP, Elav-like family member 3, CUGBP Elav-like family member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 612678 MGI: 1926034 HomoloGene: 48510 GeneCards: CELF3
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • nucleic acid binding • 7SK snRNA binding • pre-mRNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • ядерні тільця • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • flagellated sperm motility • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сперматогенез • Сплайсинг РНК • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • nuclear body organization • ncRNA transcription • mRNA splice site selection Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11189	78784
Ensembl	ENSG00000159409	ENSMUSG00000028137
UniProt	Q5SZQ8	Q8CIN6
RefSeq (мРНК)	NM_001172648 NM_001172649 NM_001291106 NM_001291107 NM_007185	NM_001289613 NM_001289616 NM_001289620 NM_172434 NM_001357784 NM_001357785 NM_001357786 NM_001357787
RefSeq (білок)	NP_001166119 NP_001166120 NP_001278035 NP_001278036 NP_009116	NP_001276542 NP_001276545 NP_001276549 NP_766022 NP_001344713 NP_001344714 NP_001344715 NP_001344716 NP_001366178 NP_001366179 NP_001366180 NP_001366181 NP_001366182 NP_001366183 NP_001366184 NP_001366185
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.7 – 151.72 Mb	Хр. 3: 94.48 – 94.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CELF3 (англ. CUGBP Elav-like family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 50 548.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKEPDAIKLF		VGQIPRHLEE		KDLKPIFEQF		GRIFELTVIK		DKYTGLHKGC
AFLTYCARDS		ALKAQSALHE		QKTLPGMNRP		IQVKPADSES		RGEDRKLFVG
MLGKQQTDED		VRKMFEPFGT		IDECTVLRGP		DGTSKGCAFV		KFQTHAEAQA
AINTLHSSRT		LPGASSSLVV		KFADTEKERG		LRRMQQVATQ		LGMFSPIALQ
FGAYSAYTQA		LMQQQAALVA		AHSAYLSPMA		TMAAVQMQHM		AAINANGLIA
TPITPSSGTS		TPPAIAATPV		SAIPAALGVN		GYSPVPTQPT		GQPAPDALYP
NGVHPYPAQS		PAAPVDPLQQ		AYAGMQHYTA		AYPAAYSLVA		PAFPQPPALV
AQQPPPPPQQ		QQQQQQQQQQ		QQQREGPDGC		NIFIYHLPQE		FTDSEILQMF
VPFGHVISAK		VFVDRATNQS		KCFGFVSFDN		PASAQAAIQA		MNGFQIGMKR
LKVQLKRPKD		ANRPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Ladd A.N., Charlet-B N., Cooper T.A. (2001). The CELF family of RNA binding proteins is implicated in cell-specific and developmentally regulated alternative splicing. Mol. Cell. Biol. 21: 1285—1296. PMID 11158314 DOI:10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Good P.J., Chen Q., Warner S.J., Herring D.C. (2000). A family of human RNA-binding proteins related to the Drosophila Bruno translational regulator. J. Biol. Chem. 275: 28583—28592. PMID 10893231 DOI:10.1074/jbc.M003083200

Див. також

• Хромосома 1