CGGBP1

CGGBP1
Ідентифікатори
Символи	CGGBP1, CGGBP, p20-CGGBP, CGG triplet repeat binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603363 MGI: 2146370 HomoloGene: 2718 GeneCards: CGGBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • double-stranded DNA binding • identical protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8545	106143
Ensembl	ENSG00000163320	ENSMUSG00000054604
UniProt	Q9UFW8	Q8BHG9
RefSeq (мРНК)	NM_001008390 NM_001195308 NM_003663	NM_178647 NM_001357416
RefSeq (білок)	NP_001008391 NP_001182237 NP_003654	NP_848762 NP_001344345
Локус (UCSC)	Хр. 3: 88.05 – 88.15 Mb	Хр. 16: 64.67 – 64.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CGGBP1 (англ. CGG triplet repeat binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 167 амінокислот, а молекулярна маса — 18 820.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERFVVTAPP		ARNRSKTALY		VTPLDRVTEF		GGELHEDGGK		LFCTSCNVVL
NHVRKSAISD		HLKSKTHTKR		KAEFEEQNVR		KKQRPLTASL		QCNSTAQTEK
VSVIQDFVKM		CLEANIPLEK		ADHPAVRAFL		SRHVKNGGSI		PKSDQLRRAY
LPDGYENENQ		LLNSQDC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Naumann F., Remus R., Schmitz B., Doerfler W. (2004). Gene structure and expression of the 5'-(CGG)(n)-3'-binding protein (CGGBP1). Genomics. 83: 106—118. PMID 14667814 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00212-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3