CHKA

CHKA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CKO, 2CKP, 2CKQ, 2I7Q, 3F2R, 3G15, 3ZM9, 4BR3, 4CG8, 4CG9, 4CGA, 4DA5, 5AFV, 5EQE, 5EQP, 5EQY, 5FTG
Ідентифікатори
Символи	CHKA, CHK, CK, CKI, EK, choline kinase alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 118491 MGI: 107760 HomoloGene: 88575 GeneCards: CHKA
шифр КФ	2.7.1.82
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein homodimerization activity • cholinesterase activity • signal transducer activity • choline binding • kinase activity • ATP binding • ethanolamine kinase activity • choline kinase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • lipid transport • ethanolamine metabolic process • choline metabolic process • фосфорилювання • lipid metabolism • response to 3-methylcholanthrene • phospholipid biosynthetic process • response to toxic substance • CDP-choline pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • phosphatidylcholine biosynthetic process • phosphatidylethanolamine biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1119	12660
Ensembl	ENSG00000110721	ENSMUSG00000024843
UniProt	P35790	O54804
RefSeq (мРНК)	NM_001277 NM_212469 NM_001376219 NM_001376220 NM_001376221 NM_001376222	NM_001025566 NM_001271496 NM_013490
RefSeq (білок)	NP_001268 NP_997634 NP_001363148 NP_001363149 NP_001363150 NP_001363151	NP_001258425 NP_038518
Локус (UCSC)	Хр. 11: 68.05 – 68.12 Mb	Хр. 19: 3.85 – 3.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHKA (англ. Choline kinase alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 52 249.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKTKFCTGGE		AEPSPLGLLL		SCGSGSAAPA		PGVGQQRDAA		SDLESKQLGG
QQPPLALPPP		PPLPLPLPLP		QPPPPQPPAD		EQPEPRTRRR		AYLWCKEFLP
GAWRGLREDE		FHISVIRGGL		SNMLFQCSLP		DTTATLGDEP		RKVLLRLYGA
ILQMRSCNKE		GSEQAQKENE		FQGAEAMVLE		SVMFAILAER		SLGPKLYGIF
PQGRLEQFIP		SRRLDTEELS		LPDISAEIAE		KMATFHGMKM		PFNKEPKWLF
GTMEKYLKEV		LRIKFTEESR		IKKLHKLLSY		NLPLELENLR		SLLESTPSPV
VFCHNDCQEG		NILLLEGREN		SEKQKLMLID		FEYSSYNYRG		FDIGNHFCEW
MYDYSYEKYP		FFRANIRKYP		TKKQQLHFIS		SYLPAFQNDF		ENLSTEEKSI
IKEEMLLEVN		RFALASHFLW		GLWSIVQAKI		SSIEFGYMDY		AQARFDAYFH
QKRKLGV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, біосинтез ліпідів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Hosaka K., Tanaka S., Nikawa J., Yamashita S. (1992). Cloning of a human choline kinase cDNA by complementation of the yeast cki mutation. FEBS Lett. 304: 229—232. PMID 1618328 DOI:10.1016/0014-5793(92)80625-Q
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Malito E., Sekulic N., Too W.C., Konrad M., Lavie A. (2006). Elucidation of human choline kinase crystal structures in complex with the products ADP or phosphocholine. J. Mol. Biol. 364: 136—151. PMID 17007874 DOI:10.1016/j.jmb.2006.08.084

Див. також

• Хромосома 11