CIR1

CIR1
Ідентифікатори
Символи	CIR1, CIR, corepressor interacting with RBPJ, 1, corepressor interacting with RBPJ
Зовнішні ІД	OMIM: 605228 MGI: 1914185 HomoloGene: 3589 GeneCards: CIR1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein kinase binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • histone deacetylase complex • цитоскелет • клітинне ядро • центр організації мікротрубочок • nuclear speck • центросома • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • mRNA processing • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9541	66935
Ensembl	ENSG00000138433	ENSMUSG00000041777
UniProt	Q86X95	Q9DA19
RefSeq (мРНК)	NM_199075 NM_004882	NM_025854
RefSeq (білок)	NP_004873	NP_080130
Локус (UCSC)	Хр. 2: 174.35 – 174.4 Mb	Хр. 2: 73.11 – 73.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CIR1 (англ. Corepressor interacting with RBPJ, 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 52 313.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKSFANFMC		KKDFHPASKS		NIKKVWMAEQ		KISYDKKKQE		ELMQQYLKEQ
ESYDNRLLMG		DERVKNGLNF		MYEAPPGAKK		ENKEKEETEG		ETEYKFEWQK
GAPREKYAKD		DMNIRDQPFG		IQVRNVRCIK		CHKWGHVNTD		RECPLFGLSG
INASSVPTDG		SGPSMHPSEL		IAEMRNSGFA		LKRNVLGRNL		TANDPSQEYV
ASEGEEDPEV		EFLKSLTTKQ		KQKLLRKLDR		LEKKKKKKDR		KKKKFQKSRS
KHKKHKSSSS		SSSSSSSSSS		TETSESSSES		ESNNKEKKIQ		RKKRKKNKCS
GHNNSDSEEK		DKSKKRKLHE		ELSSSHHNRE		KAKEKPRFLK		HESSREDSKW
SHSDSDKKSR		THKHSPEKRG		SERKEGSSRS		HGREERSRRS		RSRSPGSYKQ
RETRKRAQRN		PGEEQSRRND		SRSHGTDLYR		GEKMYREHPG		GTHTKVTQRE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• Hsieh J.J.-D., Zhou S., Chen L., Young D.B., Hayward S.D. (1999). CIR, a corepressor linking the DNA binding factor CBF1 to the histone deacetylase complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 23—28. PMID 9874765 DOI:10.1073/pnas.96.1.23
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhou S., Fujimuro M., Hsieh J.J., Chen L., Hayward S.D. (2000). A role for SKIP in EBNA2 activation of CBF1-repressed promoters. J. Virol. 74: 1939—1947. PMID 10644367 DOI:10.1128/JVI.74.4.1939-1947.2000
• Zhang J., Chen H., Weinmaster G., Hayward S.D. (2001). Epstein-Barr virus BamHi-a rightward transcript-encoded RPMS protein interacts with the CBF1-associated corepressor CIR to negatively regulate the activity of EBNA2 and NotchIC. J. Virol. 75: 2946—2956. PMID 11222720 DOI:10.1128/JVI.75.6.2946-2956.2001
• Pajerowski A.G., Nguyen C., Aghajanian H., Shapiro M.J., Shapiro V.S. (2009). NKAP is a transcriptional repressor of notch signaling and is required for T cell development. Immunity. 30: 696—707. PMID 19409814 DOI:10.1016/j.immuni.2009.02.011

Див. також

• Хромосома 2