CLASRP

CLASRP
Ідентифікатори
Символи	CLASRP, CLASP, SFRS16, SWAP2, CLK4 associating serine/arginine rich protein
Зовнішні ІД	OMIM: 618532 MGI: 1855695 GeneCards: CLASRP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • Сплайсинг РНК • mRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11129	53609
Ensembl	ENSG00000104859	ENSMUSG00000061028
UniProt	Q8N2M8	Q8CFC7
RefSeq (мРНК)	NM_001278439 NM_007056	NM_016680
RefSeq (білок)	NP_001265368 NP_008987 NP_008987.2	NP_057889
Локус (UCSC)	Хр. 19: 45.04 – 45.07 Mb	Хр. 7: 19.58 – 19.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLASRP (англ. CLK4 associating serine/arginine rich protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 674 амінокислот, а молекулярна маса — 77 161.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWHEARKHER		KLRGMMVDYK		KRAERRREYY		EKIKKDPAQF		LQVHGRACKV
HLDSAVALAA		ESPVNMMPWQ		GDTNNMIDRF		DVRAHLDHIP		DYTPPLLTTI
SPEQESDERK		CNYERYRGLV		QNDFAGISEE		QCLYQIYIDE		LYGGLQRPSE
DEKKKLAEKK		ASIGYTYEDS		TVAKVEKAAE		KPEEEESAAE		EESNSDEDEV
IPDIDVEVDV		DELNQEQVAD		LNKQATTYGM		ADGDFVRMLR		KDKEEAEAIK
HAKALEEEKA		MYSGRRSRRQ		RREFREKRLR		GRKISPPSYA		RRDSPTYDPY
KRSPSESSSE		SRSRSRSPTP		GREEKITFIT		SFGGSDEEAA		AAAAAAAASG
VTTGKPPAPP		QPGGPAPGRN		ASARRRSSSS		SSSSSASRTS		SSRSSSRSSS
RSRRGGGYYR		SGRHARSRSR		SWSRSRSRSR		RYSRSRSRGR		RHSGGGSRDG
HRYSRSPARR		GGYGPRRRSR		SRSHSGDRYR		RGGRGLRHHS		SSRSRSSWSL
SPSRSRSLTR		SRSHSPSPSQ		SRSRSRSRSQ		SPSPSPAREK		LTRPAASPAV
GEKLKKTEPA		AGKETGAAKP		KLTPQEKLKL		RMQKALNRQF		KADKKAAQEK
MIQQEHERQE		REDELRAMAR		KIRMKERERR		EKEREEWERQ		YSRQSRSPSP
RYSREYSSSR		RRSRSRSRSP		HYRH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19