CLK1

CLK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Z57, 2VAG, 5J1V, 5J1W
Ідентифікатори
Символи	CLK1, CLK, CLK/STY, STY, CDC like kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601951 MGI: 107403 HomoloGene: 101535 GeneCards: CLK1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein serine/threonine/tyrosine kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • protein kinase activity • protein tyrosine kinase activity • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • kinase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • protein autophosphorylation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • regulation of RNA splicing • protein phosphorylation • проліферація • peptidyl-threonine phosphorylation • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • фосфорилювання Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1195	12747
Ensembl	ENSG00000013441	ENSMUSG00000026034
UniProt	P49759	P22518
RefSeq (мРНК)	NM_001024646 NM_001162407 NM_004071	NM_001042634 NM_009905
RefSeq (білок)	NP_001155879 NP_004062	NP_001036099
Локус (UCSC)	Хр. 2: 200.85 – 200.86 Mb	Хр. 1: 58.45 – 58.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLK1 (англ. CDC like kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 484 амінокислот, а молекулярна маса — 57 291.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRHSKRTYCP		DWDDKDWDYG		KWRSSSSHKR		RKRSHSSAQE		NKRCKYNHSK
MCDSHYLESR		SINEKDYHSR		RYIDEYRNDY		TQGCEPGHRQ		RDHESRYQNH
SSKSSGRSGR		SSYKSKHRIH		HSTSHRRSHG		KSHRRKRTRS		VEDDEEGHLI
CQSGDVLSAR		YEIVDTLGEG		AFGKVVECID		HKAGGRHVAV		KIVKNVDRYC
EAARSEIQVL		EHLNTTDPNS		TFRCVQMLEW		FEHHGHICIV		FELLGLSTYD
FIKENGFLPF		RLDHIRKMAY		QICKSVNFLH		SNKLTHTDLK		PENILFVQSD
YTEAYNPKIK		RDERTLINPD		IKVVDFGSAT		YDDEHHSTLV		STRHYRAPEV
ILALGWSQPC		DVWSIGCILI		EYYLGFTVFP		THDSKEHLAM		MERILGPLPK
HMIQKTRKRK		YFHHDRLDWD		EHSSAGRYVS		RRCKPLKEFM		LSQDVEHERL
FDLIQKMLEY		DPAKRITLRE		ALKHPFFDLL		KKSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Hanes J.J., der Kammer H., Klaudiny J.J., Scheit K.H. (1994). Characterization by cDNA cloning of two new human protein kinases. Evidence by sequence comparison of a new family of mammalian protein kinases. J. Mol. Biol. 244: 665—672. PMID 7990150 DOI:10.1006/jmbi.1994.1763
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Moeslein F.M., Myers M.P., Landreth G.E. (1999). The CLK family kinases, CLK1 and CLK2, phosphorylate and activate the tyrosine phosphatase, PTP-1B. J. Biol. Chem. 274: 26697—26704. PMID 10480872 DOI:10.1074/jbc.274.38.26697
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Johnson K.W., Smith K.A. (1991). Molecular cloning of a novel human cdc2/CDC28-like protein kinase. J. Biol. Chem. 266: 3402—3407. PMID 1704889

Див. також

• Хромосома 2