CLK2

CLK2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3NR9
Ідентифікатори
Символи	CLK2, CDC like kinase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602989 MGI: 1098669 HomoloGene: 33303 GeneCards: CLK2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • protein kinase activity • protein serine/threonine/tyrosine kinase activity • ATP binding • nucleotide binding • protein tyrosine kinase activity • transferase activity • identical protein binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • nuclear speck • ядерні тільця Біологічний процес • negative regulation of gluconeogenesis • regulation of RNA splicing • фосфорилювання • protein phosphorylation • protein autophosphorylation • response to organic substance • response to ionizing radiation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • response to retinoic acid Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1196	12748
Ensembl	ENSG00000261893 ENSG00000176444	ENSMUSG00000068917
UniProt	P49760	O35491
RefSeq (мРНК)	NM_001291 NM_001294338 NM_001294339 NM_003993 NM_001363704	NM_001163432 NM_007712
RefSeq (білок)	NP_001281267 NP_001281268 NP_003984 NP_001350633	NP_001156904 NP_031738
Локус (UCSC)	Хр. 1: 155.26 – 155.28 Mb	Хр. 3: 89.07 – 89.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLK2 (англ. CDC like kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 499 амінокислот, а молекулярна маса — 60 090.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPHPRRYHSS		ERGSRGSYRE		HYRSRKHKRR		RSRSWSSSSD		RTRRRRREDS
YHVRSRSSYD		DRSSDRRVYD		RRYCGSYRRN		DYSRDRGDAY		YDTDYRHSYE
YQRENSSYRS		QRSSRRKHRR		RRRRSRTFSR		SSSQHSSRRA		KSVEDDAEGH
LIYHVGDWLQ		ERYEIVSTLG		EGTFGRVVQC		VDHRRGGARV		ALKIIKNVEK
YKEAARLEIN		VLEKINEKDP		DNKNLCVQMF		DWFDYHGHMC		ISFELLGLST
FDFLKDNNYL		PYPIHQVRHM		AFQLCQAVKF		LHDNKLTHTD		LKPENILFVN
SDYELTYNLE		KKRDERSVKS		TAVRVVDFGS		ATFDHEHHST		IVSTRHYRAP
EVILELGWSQ		PCDVWSIGCI		IFEYYVGFTL		FQTHDNREHL		AMMERILGPI
PSRMIRKTRK		QKYFYRGRLD		WDENTSAGRY		VRENCKPLRR		YLTSEAEEHH
QLFDLIESML		EYEPAKRLTL		GEALQHPFFA		RLRAEPPNKL		WDSSRDISR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Hanes J.J., der Kammer H., Klaudiny J.J., Scheit K.H. (1994). Characterization by cDNA cloning of two new human protein kinases. Evidence by sequence comparison of a new family of mammalian protein kinases. J. Mol. Biol. 244: 665—672. PMID 7990150 DOI:10.1006/jmbi.1994.1763
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee K., Du C., Horn M., Rabinow L. (1996). Activity and autophosphorylation of LAMMER protein kinases. J. Biol. Chem. 271: 27299—27303. PMID 8910305 DOI:10.1074/jbc.271.44.27299
• Duncan P.I., Stojdl D.F., Marius R.M., Scheit K.H., Bell J.C. (1998). The Clk2 and Clk3 dual-specificity protein kinases regulate the intranuclear distribution of SR proteins and influence pre-mRNA splicing. Exp. Cell Res. 241: 300—308. PMID 9637771 DOI:10.1006/excr.1998.4083
• Moeslein F.M., Myers M.P., Landreth G.E. (1999). The CLK family kinases, CLK1 and CLK2, phosphorylate and activate the tyrosine phosphatase, PTP-1B. J. Biol. Chem. 274: 26697—26704. PMID 10480872 DOI:10.1074/jbc.274.38.26697
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома 1