CNOT1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CNOT1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CNOT1, CDC39, NOT1, NOT1H, AD-005, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, HPE12, VIBOS
Зовнішні ІД OMIM: 604917 MGI: 2442402 HomoloGene: 9453 GeneCards: CNOT1
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001265612
NM_016284
NM_206999
NM_001205226
NM_153164
NM_178078
NM_001372351
NM_001372353
RefSeq (білок)
NP_001252541
NP_057368
NP_996882
NP_001192155
NP_694804
NP_835179
NP_001359280
NP_001359282
Локус (UCSC) Хр. 16: 58.52 – 58.63 Mb Хр. 8: 96.45 – 96.53 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CNOT1 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 376 амінокислот, а молекулярна маса — 266 939[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNLDSLSLALSQISYLVDNLTKKNYRASQQEIQHIVNRHGPEADRHLLRC
LFSHVDFSGDGKSSGKDFHQTQFLIQECALLITKPNFISTLSYAIDNPLH
YQKSLKPAPHLFAQLSKVLKLSKVQEVIFGLALLNSSSSDLRGFAAQFIK
QKLPDLLRSYIDADVSGNQEGGFQDIAIEVLHLLLSHLLFGQKGAFGVGQ
EQIDAFLKTLRRDFPQERCPVVLAPLLYPEKRDILMDRILPDSGGVAKTM
MESSLADFMQEVGYGFCASIEECRNIIVQFGVREVTAAQVARVLGMMART
HSGLTDGIPLQSISAPGSGIWSDGKDKSDGAQAHTWNVEVLIDVLKELNP
SLNFKEVTYELDHPGFQIRDSKGLHNVVYGIQRGLGMEVFPVDLIYRPWK
HAEGQLSFIQHSLINPEIFCFADYPCHTVATDILKAPPEDDNREIATWKS
LDLIESLLRLAEVGQYEQVKQLFSFPIKHCPDMLVLALLQINTSWHTLRH
ELISTLMPIFLGNHPNSAIILHYAWHGQGQSPSIRQLIMHAMAEWYMRGE
QYDQAKLSRILDVAQDLKALSMLLNGTPFAFVIDLAALASRREYLKLDKW
LTDKIREHGEPFIQACMTFLKRRCPSILGGLAPEKDQPKSAQLPPETLAT
MLACLQACAGSVSQELSETILTMVANCSNVMNKARQPPPGVMPKGRPPSA
SSLDAISPVQIDPLAGMTSLSIGGSAAPHTQSMQGFPPNLGSAFSTPQSP
AKAFPPLSTPNQTTAFSGIGGLSSQLPVGGLGTGSLTGIGTGALGLPAVN
NDPFVQRKLGTSGLNQPTFQQSKMKPSDLSQVWPEANQHFSKEIDDEANS
YFQRIYNHPPHPTMSVDEVLEMLQRFKDSTIKREREVFNCMLRNLFEEYR
FFPQYPDKELHITACLFGGIIEKGLVTYMALGLALRYVLEALRKPFGSKM
YYFGIAALDRFKNRLKDYPQYCQHLASISHFMQFPHHLQEYIEYGQQSRD
PPVKMQGSITTPGSIALAQAQAQAQVPAKAPLAGQVSTMVTTSTTTTVAK
TVTVTRPTGVSFKKDVPPSINTTNIDTLLVATDQTERIVEPPENIQEKIA
FIFNNLSQSNMTQKVEELKETVKEEFMPWVSQYLVMKRVSIEPNFHSLYS
NFLDTLKNPEFNKMVLNETYRNIKVLLTSDKAAANFSDRSLLKNLGHWLG
MITLAKNKPILHTDLDVKSLLLEAYVKGQQELLYVVPFVAKVLESSIRSV
VFRPPNPWTMAIMNVLAELHQEHDLKLNLKFEIEVLCKNLALDINELKPG
NLLKDKDRLKNLDEQLSAPKKDVKQPEELPPITTTTTSTTPATNTTCTAT
VPPQPQYSYHDINVYSLAGLAPHITLNPTIPLFQAHPQLKQCVRQAIERA
VQELVHPVVDRSIKIAMTTCEQIVRKDFALDSEESRMRIAAHHMMRNLTA
GMAMITCREPLLMSISTNLKNSFASALRTASPQQREMMDQAAAQLAQDNC
ELACCFIQKTAVEKAGPEMDKRLATEFELRKHARQEGRRYCDPVVLTYQA
ERMPEQIRLKVGGVDPKQLAVYEEFARNVPGFLPTNDLSQPTGFLAQPMK
QAWATDDVAQIYDKCITELEQHLHAIPPTLAMNPQAQALRSLLEVVVLSR
NSRDAIAALGLLQKAVEGLLDATSGADADLLLRYRECHLLVLKALQDGRA
YGSPWCNKQITRCLIECRDEYKYNVEAVELLIRNHLVNMQQYDLHLAQSM
ENGLNYMAVAFAMQLVKILLVDERSVAHVTEADLFHTIETLMRINAHSRG
NAPEGLPQLMEVVRSNYEAMIDRAHGGPNFMMHSGISQASEYDDPPGLRE
KAEYLLREWVNLYHSAAAGRDSTKAFSAFVGQMHQQGILKTDDLITRFFR
LCTEMCVEISYRAQAEQQHNPAANPTMIRAKCYHNLDAFVRLIALLVKHS
GEATNTVTKINLLNKVLGIVVGVLLQDHDVRQSEFQQLPYHRIFIMLLLE
LNAPEHVLETINFQTLTAFCNTFHILRPTKAPGFVYAWLELISHRIFIAR
MLAHTPQQKGWPMYAQLLIDLFKYLAPFLRNVELTKPMQILYKGTLRVLL
VLLHDFPEFLCDYHYGFCDVIPPNCIQLRNLILSAFPRNMRLPDPFTPNL
KVDMLSEINIAPRILTNFTGVMPPQFKKDLDSYLKTRSPVTFLSDLRSNL
QVSNEPGNRYNLQLINALVLYVGTQAIAHIHNKGSTPSMSTITHSAHMDI
FQNLAVDLDTEGRYLFLNAIANQLRYPNSHTHYFSCTMLYLFAEANTEAI
QEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNPAFKFWNHEFVHCAPEIE
KLFQSVAQCCMGQKQAQQVMEGTGAS

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Winkler G.S., Mulder K.W., Bardwell V.J., Kalkhoven E., Timmers H.T. (2006). Human Ccr4-Not complex is a ligand-dependent repressor of nuclear receptor-mediated transcription. EMBO J. 25: 3089—3099. PMID 16778766 DOI:10.1038/sj.emboj.7601194
  • Braun J.E., Huntzinger E., Fauser M., Izaurralde E. (2011). GW182 proteins directly recruit cytoplasmic deadenylase complexes to miRNA targets. Mol. Cell. 44: 120—133. PMID 21981923 DOI:10.1016/j.molcel.2011.09.007
  • Sandler H., Kreth J., Timmers H.T., Stoecklin G. (2011). Not1 mediates recruitment of the deadenylase Caf1 to mRNAs targeted for degradation by tristetraprolin. Nucleic Acids Res. 39: 4373—4386. PMID 21278420 DOI:10.1093/nar/gkr011
  • Ito K., Takahashi A., Morita M., Suzuki T., Yamamoto T. (2011). The role of the CNOT1 subunit of the CCR4-NOT complex in mRNA deadenylation and cell viability. Protein Cell. 2: 755—763. PMID 21976065 DOI:10.1007/s13238-011-1092-4

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7877 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
  4. UniProt, A5YKK6 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]