CNOT8

CNOT8
Ідентифікатори
Символи	CNOT8, CAF1, CALIF, Caf1b, POP2, hCAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 8
Зовнішні ІД	OMIM: 603731 MGI: 1916375 HomoloGene: 48304 GeneCards: CNOT8
Онтологія гена Молекулярна функція • poly(A)-specific ribonuclease activity • 3'-5'-exoribonuclease activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • CCR4-NOT complex • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • P-body • CCR4-NOT core complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • positive regulation of mRNA catabolic process • transcription, DNA-templated • gene silencing by miRNA • positive regulation of cell population proliferation • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • Сайленсинг генів • regulation of translation • negative regulation of cell population proliferation • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • negative regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9337	69125
Ensembl	ENSG00000155508	ENSMUSG00000020515
UniProt	Q9UFF9	Q9D8X5
RefSeq (мРНК)	NM_001301073 NM_001301074 NM_001301075 NM_001301077 NM_001301080 NM_001301082 NM_001301083 NM_001301086 NM_004779	NM_026949 NM_001356477 NM_001363084 NM_001363085 NM_001363086
RefSeq (білок)	NP_001288002 NP_001288003 NP_001288004 NP_001288006 NP_001288009 NP_001288011 NP_001288012 NP_001288015 NP_004770	NP_081225 NP_001343406 NP_001350013 NP_001350014 NP_001350015
Локус (UCSC)	Хр. 5: 154.86 – 154.88 Mb	Хр. 11: 57.99 – 58.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNOT8 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 292 амінокислот, а молекулярна маса — 33 540.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAALVENSQ		VICEVWASNL		EEEMRKIREI		VLSYSYIAMD		TEFPGVVVRP
IGEFRSSIDY		QYQLLRCNVD		LLKIIQLGLT		FTNEKGEYPS		GINTWQFNFK
FNLTEDMYSQ		DSIDLLANSG		LQFQKHEEEG		IDTLHFAELL		MTSGVVLCDN
VKWLSFHSGY		DFGYMVKLLT		DSRLPEEEHE		FFHILNLFFP		SIYDVKYLMK
SCKNLKGGLQ		EVADQLDLQR		IGRQHQAGSD		SLLTGMAFFR		MKELFFEDSI
DDAKYCGRLY		GLGTGVAQKQ		NEDVDSAQEK		MSILAIINNM		QQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Fidler C., Wainscoat J.S., Boultwood J. (1999). The human POP2 gene: identification, sequencing, and mapping to the critical region of the 5q- syndrome. Genomics. 56: 134—136. PMID 10036195 DOI:10.1006/geno.1998.5687
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bianchin C., Mauxion F., Sentis S., Seraphin B., Corbo L. (2005). Conservation of the deadenylase activity of proteins of the Caf1 family in human. RNA. 11: 487—494. PMID 15769875 DOI:10.1261/rna.7135305
• Aslam A., Mittal S., Koch F., Andrau J.C., Winkler G.S. (2009). The Ccr4-NOT deadenylase subunits CNOT7 and CNOT8 have overlapping roles and modulate cell proliferation. Mol. Biol. Cell. 20: 3840—3850. PMID 19605561 DOI:10.1091/mbc.E09-02-0146
• Piao X., Zhang X., Wu L., Belasco J.G. (2010). CCR4-NOT deadenylates mRNA associated with complexes in human cells. Mol. Cell. Biol. 30: 1486—1494. PMID 20065043 DOI:10.1128/MCB.01481-09
• Doidge R., Mittal S., Aslam A., Winkler G.S. (2012). The anti-proliferative activity of BTG/TOB proteins is mediated via the Caf1a (CNOT7) and Caf1b (CNOT8) deadenylase subunits of the Ccr4-not complex. PLoS ONE. 7: E51331—E51331. PMID 23236473 DOI:10.1371/journal.pone.0051331

Див. також

• Хромосома 5