CNOT9

CNOT9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FV2, 4CRU, 4CRV, 4CT6, 4CT7
Ідентифікатори
Символи	CNOT9, CT129, RCD-1, RCD1, CAF40, RQCD1, CCR4-NOT transcription complex subunit 9
Зовнішні ІД	OMIM: 612054 MGI: 1928902 HomoloGene: 3973 GeneCards: CNOT9
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • epidermal growth factor receptor binding • kinase binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • CCR4-NOT complex • P-body • CCR4-NOT core complex • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • negative regulation of translation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • mRNA catabolic process • cytokine-mediated signaling pathway • sex differentiation • transcription, DNA-templated • Сайленсинг генів • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • regulation of translation • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9125	58184
Ensembl	ENSG00000144580	ENSMUSG00000026174
UniProt	Q92600	Q9JKY0
RefSeq (мРНК)	NM_001271634 NM_001271635 NM_005444	NM_021383
RefSeq (білок)	NP_001258563 NP_001258564 NP_005435	NP_067358
Локус (UCSC)	Хр. 2: 218.57 – 218.6 Mb	Хр. 1: 74.55 – 74.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNOT9 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 299 амінокислот, а молекулярна маса — 33 631.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHSLATAAPV		PTTLAQVDRE		KIYQWINELS		SPETRENALL		ELSKKRESVP
DLAPMLWHSF		GTIAALLQEI		VNIYPSINPP		TLTAHQSNRV		CNALALLQCV
ASHPETRSAF		LAAHIPLFLY		PFLHTVSKTR		PFEYLRLTSL		GVIGALVKTD
EQEVINFLLT		TEIIPLCLRI		MESGSELSKT		VATFILQKIL		LDDTGLAYIC
QTYERFSHVA		MILGKMVLQL		SKEPSARLLK		HVVRCYLRLS		DNPRAREALR
QCLPDQLKDT		TFAQVLKDDT		TTKRWLAQLV		KNLQEGQVTD		PRGIPLPPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Garapaty S., Mahajan M.A., Samuels H.H. (2008). Components of the CCR4-NOT complex function as nuclear hormone receptor coactivators via association with the NRC-interacting Factor NIF-1. J. Biol. Chem. 283: 6806—6816. PMID 18180299 DOI:10.1074/jbc.M706986200
• Mauxion F., Preve B., Seraphin B. (2013). C2ORF29/CNOT11 and CNOT10 form a new module of the CCR4-NOT complex. RNA Biol. 10: 267—276. PMID 23232451 DOI:10.4161/rna.23065
• Garces R.G., Gillon W., Pai E.F. (2007). Atomic model of human Rcd-1 reveals an armadillo-like-repeat protein with in vitro nucleic acid binding properties. Protein Sci. 16: 176—188. PMID 17189474 DOI:10.1110/ps.062600507

Див. також

• Хромосома 2