COPS5

COPS5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4D10, 4D18, 4F7O, 4WSN
Ідентифікатори
Символи	COPS5, CSN5, JAB1, MOV-34, SGN5, COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 5, COP9 signalosome subunit 5
Зовнішні ІД	OMIM: 604850 MGI: 1349415 HomoloGene: 55992 GeneCards: COPS5
Онтологія гена Молекулярна функція • translation initiation factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • hydrolase activity • metallopeptidase activity • NEDD8-specific protease activity • enzyme binding • macrophage migration inhibitory factor binding • metalloendopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • eukaryotic translation initiation factor 3 complex • Синаптичні бульбашки • синапс • нуклеоплазма • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • COP9 signalosome • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • Хроматин • гіалоплазма Біологічний процес • Біосинтез білків • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • transcription by RNA polymerase II • протеоліз • regulation of cell cycle • protein deubiquitination • regulation of JNK cascade • exosomal secretion • transcription-coupled nucleotide-excision repair • regulation of IRE1-mediated unfolded protein response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • translational initiation • protein deneddylation • посттрансляційна модифікація • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10987	26754
Ensembl	ENSG00000121022	ENSMUSG00000025917
UniProt	Q92905	O35864
RefSeq (мРНК)	NM_006837	NM_001277101 NM_013715
RefSeq (білок)	NP_006828 NP_006828.2	NP_001264030 NP_038743
Локус (UCSC)	Хр. 8: 67.04 – 67.08 Mb	Хр. 1: 10.09 – 10.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COPS5 (англ. COP9 signalosome subunit 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 334 амінокислот, а молекулярна маса — 37 579.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAASGSGMAQ		KTWELANNMQ		EAQSIDEIYK		YDKKQQQEIL		AAKPWTKDHH
YFKYCKISAL		ALLKMVMHAR		SGGNLEVMGL		MLGKVDGETM		IIMDSFALPV
EGTETRVNAQ		AAAYEYMAAY		IENAKQVGRL		ENAIGWYHSH		PGYGCWLSGI
DVSTQMLNQQ		FQEPFVAVVI		DPTRTISAGK		VNLGAFRTYP		KGYKPPDEGP
SEYQTIPLNK		IEDFGVHCKQ		YYALEVSYFK		SSLDRKLLEL		LWNKYWVNTL
SSSSLLTNAD		YTTGQVFDLS		EKLEQSEAQL		GRGSFMLGLE		THDRKSEDKL
AKATRDSCKT		TIEAIHGLMS		QVIKDKLFNQ		INIS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• Claret F.-X., Hibi M., Dhut S., Toda T., Karin M. (1996). A new group of conserved coactivators that increase the specificity of AP-1 transcription factors. Nature. 383: 453—457. PMID 8837781 DOI:10.1038/383453a0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chauchereau A., Georgiakaki M., Perrin-Wolff M., Milgrom E., Loosfelt H. (2000). JAB1 interacts with both the progesterone receptor and SRC-1. J. Biol. Chem. 275: 8540—8548. PMID 10722692 DOI:10.1074/jbc.275.12.8540
• Zou Y., Lim S., Lee K., Deng X., Friedman E. (2003). Serine/threonine kinase Mirk/Dyrk1B is an inhibitor of epithelial cell migration and is negatively regulated by the Met adaptor Ran-binding protein M. J. Biol. Chem. 278: 49573—49581. PMID 14500717 DOI:10.1074/jbc.M307556200
• Yun J., Tomida A., Andoh T., Tsuruo T. (2004). Interaction between glucose-regulated destruction domain of DNA topoisomerase IIalpha and MPN domain of Jab1/CSN5. J. Biol. Chem. 279: 31296—31303. PMID 15126503 DOI:10.1074/jbc.M401411200
• Granata A., Koo S.J., Haucke V., Schiavo G., Warner T.T. (2011). CSN complex controls the stability of selected synaptic proteins via a torsinA-dependent process. EMBO J. 30: 181—193. PMID 21102408 DOI:10.1038/emboj.2010.285

Див. також

• Хромосома 8