CSTF2

CSTF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1P1T, 2J8P
Ідентифікатори
Символи	CSTF2, CstF-64, cleavage stimulation factor subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 300907 MGI: 1343054 HomoloGene: 80171 GeneCards: CSTF2
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • cleavage body • Нуклеоплазма • клітинне ядро • Ядерні тільця Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA 3'-end processing • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation • mRNA polyadenylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1478	108062
Ensembl	ENSG00000101811	ENSMUSG00000031256
UniProt	P33240	Q8BIQ5
RefSeq (мРНК)	NM_001306206 NM_001306209 NM_001325	NM_001290398 NM_001290399 NM_133196 NM_001359053 NM_001359054
RefSeq (білок)	NP_001293135 NP_001293138 NP_001316 NP_001293135.1	NP_001277327 NP_001277328 NP_573459 NP_001345982 NP_001345983
Локус (UCSC)	Хр. X: 100.82 – 100.84 Mb	Хр. X: 132.96 – 132.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CSTF2 (англ. Cleavage stimulation factor subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 577 амінокислот, а молекулярна маса — 60 959.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGLTVRDPA		VDRSLRSVFV		GNIPYEATEE		QLKDIFSEVG		PVVSFRLVYD
RETGKPKGYG		FCEYQDQETA		LSAMRNLNGR		EFSGRALRVD		NAASEKNKEE
LKSLGTGAPV		IESPYGETIS		PEDAPESISK		AVASLPPEQM		FELMKQMKLC
VQNSPQEARN		MLLQNPQLAY		ALLQAQVVMR		IVDPEIALKI		LHRQTNIPTL
IAGNPQPVHG		AGPGSGSNVS		MNQQNPQAPQ		AQSLGGMHVN		GAPPLMQASM
QGGVPAPGQM		PAAVTGPGPG		SLAPGGGMQA		QVGMPGSGPV		SMERGQVPMQ
DPRAAMQRGS		LPANVPTPRG		LLGDAPNDPR		GGTLLSVTGE		VEPRGYLGPP
HQGPPMHHVP		GHESRGPPPH		ELRGGPLPEP		RPLMAEPRGP		MLDQRGPPLD
GRGGRDPRGI		DARGMEARAM		EARGLDARGL		EARAMEARAM		EARAMEARAM
EARAMEVRGM		EARGMDTRGP		VPGPRGPIPS		GMQGPSPINM		GAVVPQGSRQ
VPVMQGTGMQ		GASIQGGSQP		GGFSPGQNQV		TPQDHEKAAL		IMQVLQLTAD
QIAMLPPEQR		QSILILKEQI		QKSTGAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Takagaki Y., Macdonald C.C., Shenk T., Manley J.L. (1992). The human 64-kDa polyadenylylation factor contains a ribonucleoprotein-type RNA binding domain and unusual auxiliary motifs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1403—1407. PMID 1741396 DOI:10.1073/pnas.89.4.1403
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takagaki Y., Manley J.L. (1997). RNA recognition by the human polyadenylation factor CstF. Mol. Cell. Biol. 17: 3907—3914. PMID 9199325 DOI:10.1128/MCB.17.7.3907
• Takagaki Y., Manley J.L. (2000). Complex protein interactions within the human polyadenylation machinery identify a novel component. Mol. Cell. Biol. 20: 1515—1525. PMID 10669729 DOI:10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000
• Calvo O., Manley J.L. (2001). Evolutionarily conserved interaction between CstF-64 and PC4 links transcription, polyadenylation, and termination. Mol. Cell. 7: 1013—1023. PMID 11389848 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00236-2
• Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070

Див. також

• Хромосома X