CXXC5

CXXC5
Ідентифікатори
Символи	CXXC5, CF5, RINF, WID, HSPC195, CXXC finger protein 5
Зовнішні ІД	OMIM: 612752 MGI: 1914643 HomoloGene: 9517 GeneCards: CXXC5
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • zinc ion binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51523	67393
Ensembl	ENSG00000171604	ENSMUSG00000046668
UniProt	Q7LFL8	Q91WA4
RefSeq (мРНК)	NM_016463 NM_001317199 NM_001317200 NM_001317201 NM_001317202 NM_001317203 NM_001317204 NM_001317205 NM_001317206 NM_001317207 NM_001317208 NM_001317209 NM_001317210 NM_001317211	NM_133687 NM_001357458 NM_001357459
RefSeq (білок)	NP_001304128 NP_001304129 NP_001304130 NP_001304131 NP_001304132 NP_001304133 NP_001304134 NP_001304135 NP_001304136 NP_001304137 NP_001304138 NP_001304139 NP_001304140 NP_057547	NP_598448 NP_001344387 NP_001344388
Локус (UCSC)	Хр. 5: 139.65 – 139.68 Mb	Хр. 18: 35.96 – 35.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CXXC5 (англ. CXXC finger protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 322 амінокислот, а молекулярна маса — 32 977.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSLGGGSQD		AGGSSSSSTN		GSGGSGSSGP		KAGAADKSAV		VAAAAPASVA
DDTPPPERRN		KSGIISEPLN		KSLRRSRPLS		HYSSFGSSGG		SGGGSMMGGE
SADKATAAAA		AASLLANGHD		LAAAMAVDKS		NPTSKHKSGA		VASLLSKAER
ATELAAEGQL		TLQQFAQSTE		MLKRVVQEHL		PLMSEAGAGL		PDMEAVAGAE
ALNGQSDFPY		LGAFPINPGL		FIMTPAGVFL		AESALHMAGL		AEYPMQGELA
SAISSGKKKR		KRCGMCAPCR		RRINCEQCSS		CRNRKTGHQI		CKFRKCEELK
KKPSAALEKV		MLPTGAAFRW		FQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5