DDX1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
DDX1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи DDX1, DBP-RB, UKVH5d, DEAD/H-box helicase 1, DEAD-box helicase 1
Зовнішні ІД OMIM: 601257 MGI: 2144727 HomoloGene: 3627 GeneCards: DDX1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_004939
NM_134040
RefSeq (білок)
NP_004930
NP_598801
Локус (UCSC) Хр. 2: 15.59 – 15.63 Mb Хр. 12: 13.27 – 13.3 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DDX1 (англ. DEAD-box helicase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 82 432[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAFSEMGVMPEIAQAVEEMDWLLPTDIQAESIPLILGGGDVLMAAETGS
GKTGAFSIPVIQIVYETLKDQQEGKKGKTTIKTGASVLNKWQMNPYDRGS
AFAIGSDGLCCQSREVKEWHGCRATKGLMKGKHYYEVSCHDQGLCRVGWS
TMQASLDLGTDKFGFGFGGTGKKSHNKQFDNYGEEFTMHDTIGCYLDIDK
GHVKFSKNGKDLGLAFEIPPHMKNQALFPACVLKNAELKFNFGEEEFKFP
PKDGFVALSKAPDGYIVKSQHSGNAQVTQTKFLPNAPKALIVEPSRELAE
QTLNNIKQFKKYIDNPKLRELLIIGGVAARDQLSVLENGVDIVVGTPGRL
DDLVSTGKLNLSQVRFLVLDEADGLLSQGYSDFINRMHNQIPQVTSDGKR
LQVIVCSATLHSFDVKKLSEKIMHFPTWVDLKGEDSVPDTVHHVVVPVNP
KTDRLWERLGKSHIRTDDVHAKDNTRPGANSPEMWSEAIKILKGEYAVRA
IKEHKMDQAIIFCRTKIDCDNLEQYFIQQGGGPDKKGHQFSCVCLHGDRK
PHERKQNLERFKKGDVRFLICTDVAARGIDIHGVPYVINVTLPDEKQNYV
HRIGRVGRAERMGLAISLVATEKEKVWYHVCSSRGKGCYNTRLKEDGGCT
IWYNEMQLLSEIEEHLNCTISQVEPDIKVPVDEFDGKVTYGQKRAAGGGS
YKGHVDILAPTVQELAALEKEAQTSFLHLGYLPNQLFRTF

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, процесинг тРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література[ред. | ред. код]

  • Godbout R., Squire J. (1993). Amplification of a DEAD box protein gene in retinoblastoma cell lines.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 7578 — 7582.  PMID 7689221 DOI:10.1073/pnas.90.16.7578
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Chen H.C., Lin W.C., Tsay Y.G., Lee S.C., Chang C.J. (2002). An RNA helicase, DDX1, interacting with poly(A) RNA and heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K.. J. Biol. Chem. 277: 40403 — 40409.  PMID 12183465 DOI:10.1074/jbc.M206981200
  • Li L., Monckton E.A., Godbout R. (2008). A role for DEAD box 1 at DNA double-strand breaks.. Mol. Cell. Biol. 28: 6413 — 6425.  PMID 18710941 DOI:10.1128/MCB.01053-08
  • Popow J., Jurkin J., Schleiffer A., Martinez J. (2014). Analysis of orthologous groups reveals archease and DDX1 as tRNA splicing factors.. Nature. 511: 104 — 107.  PMID 24870230 DOI:10.1038/nature13284
  • Kellner J.N., Meinhart A. (2015). Structure of the SPRY domain of the human RNA helicase DDX1, a putative interaction platform within a DEAD-box protein.. Acta Crystallogr. F. 71: 1176 — 1188.  PMID 26323305 DOI:10.1107/S2053230X15013709

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2734 (англ.). Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 27 лютого 2017. 
  4. UniProt, Q92499 (англ.). Архів оригіналу за 6 травня 2017. Процитовано 27 лютого 2017. 

Див. також[ред. | ред. код]