DDX18

DDX18
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3LY5
Ідентифікатори
Символи	DDX18, MrDb, DEAD-box helicase 18, Has1
Зовнішні ІД	OMIM: 606355 MGI: 1914192 HomoloGene: 6697 GeneCards: DDX18
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • мембрана • клітинне ядро • хромосома • цитоплазма Біологічний процес • RNA secondary structure unwinding • cellular response to estradiol stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8886	66942
Ensembl	ENSG00000088205	ENSMUSG00000001674
UniProt	Q9NVP1 Q8N254	Q8K363
RefSeq (мРНК)	NM_006773	NM_025860
RefSeq (білок)	NP_006764 NP_006764.3	NP_080136
Локус (UCSC)	Хр. 2: 117.81 – 117.83 Mb	Хр. 1: 121.48 – 121.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX18 (англ. DEAD-box helicase 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 670 амінокислот, а молекулярна маса — 75 407.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSHLPMKLLR		KKIEKRNLKL		RQRNLKFQGA		SNLTLSETQN		GDVSEETMGS
RKVKKSKQKP		MNVGLSETQN		GGMSQEAVGN		IKVTKSPQKS		TVLTNGEAAM
QSSNSESKKK		KKKKRKMVND		AEPDTKKAKT		ENKGKSEEES		AETTKETENN
VEKPDNDEDE		SEVPSLPLGL		TGAFEDTSFA		SLCNLVNENT		LKAIKEMGFT
NMTEIQHKSI		RPLLEGRDLL		AAAKTGSGKT		LAFLIPAVEL		IVKLRFMPRN
GTGVLILSPT		RELAMQTFGV		LKELMTHHVH		TYGLIMGGSN		RSAEAQKLGN
GINIIVATPG		RLLDHMQNTP		GFMYKNLQCL		VIDEADRILD		VGFEEELKQI
IKLLPTRRQT		MLFSATQTRK		VEDLARISLK		KEPLYVGVDD		DKANATVDGL
EQGYVVCPSE		KRFLLLFTFL		KKNRKKKLMV		FFSSCMSVKY		HYELLNYIDL
PVLAIHGKQK		QNKRTTTFFQ		FCNADSGTLL		CTDVAARGLD		IPEVDWIVQY
DPPDDPKEYI		HRVGRTARGL		NGRGHALLIL		RPEELGFLRY		LKQSKVPLSE
FDFSWSKISD		IQSQLEKLIE		KNYFLHKSAQ		EAYKSYIRAY		DSHSLKQIFN
VNNLNLPQVA		LSFGFKVPPF		VDLNVNSNEG		KQKKRGGGGG		FGYQKTKKVE
KSKIFKHISK		KSSDSRQFSH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sekiguchi T., Hayano T., Yanagida M., Takahashi N., Nishimoto T. (2006). NOP132 is required for proper nucleolus localization of DEAD-box RNA helicase DDX47. Nucleic Acids Res. 34: 4593—4608. PMID 16963496 DOI:10.1093/nar/gkl603
• Grandori C., Mac J., Siebelt F., Ayer D.A., Eisenman R.E. (1996). Myc-Max heterodimers activate a DEAD box gene and interact with multiple E box-related sites in vivo. EMBO J. 15: 4344—4357. PMID 8861962

Див. також

• Хромосома 2