DDX28

DDX28
Ідентифікатори
Символи	DDX28, MDEAD-box helicase 28
Зовнішні ІД	OMIM: 607618 MGI: 1919236 HomoloGene: 10164 GeneCards: DDX28
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • rRNA binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • ribonucleoprotein granule • mitochondrial nucleoid • мітохондрія • клітинне ядро • гіалоплазма • ядерце Біологічний процес • RNA secondary structure unwinding • ribosome biogenesis • mitochondrial large ribosomal subunit assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55794	71986
Ensembl	ENSG00000182810	ENSMUSG00000045538
UniProt	Q9NUL7	Q9CWT6
RefSeq (мРНК)	NM_018380	NM_028038
RefSeq (білок)	NP_060850	NP_082314
Локус (UCSC)	Хр. 16: 68.02 – 68.02 Mb	Хр. 8: 106.74 – 106.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX28 (англ. DEAD-box helicase 28) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 59 581.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALTRPVRLF		SLVTRLLLAP		RRGLTVRSPD		EPLPVVRIPV		ALQRQLEQRQ
SRRRNLPRPV		LVRPGPLLVS		ARRPELNQPA		RLTLGRWERA		PLASQGWKSR
RARRDHFSIE		RAQQEAPAVR		KLSSKGSFAD		LGLEPRVLHA		LQEAAPEVVQ
PTTVQSSTIP		SLLRGRHVVC		AAETGSGKTL		SYLLPLLQRL		LGQPSLDSLP
IPAPRGLVLV		PSRELAQQVR		AVAQPLGRSL		GLLVRDLEGG		HGMRRIRLQL
SRQPSADVLV		ATPGALWKAL		KSRLISLEQL		SFLVLDEADT		LLDESFLELV
DYILEKSHIA		EGPADLEDPF		NPKAQLVLVG		ATFPEGVGQL		LNKVASPDAV
TTITSSKLHC		IMPHVKQTFL		RLKGADKVAE		LVHILKHRDR		AERTGPSGTV
LVFCNSSSTV		NWLGYILDDH		KIQHLRLQGQ		MPALMRVGIF		QSFQKSSRDI
LLCTDIASRG		LDSTGVELVV		NYDFPPTLQD		YIHRAGRVGR		VGSEVPGTVI
SFVTHPWDVS		LVQKIELAAR		RRRSLPGLAS		SVKEPLPQAT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у такому біологічному процесі, як біогенез рибосом. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК, рРНК. Локалізований у ядрі, мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

• Valgardsdottir R., Brede G., Eide L.G., Frengen E., Prydz H. (2001). Cloning and characterization of MDDX28, a putative dead-box helicase with mitochondrial and nuclear localization. J. Biol. Chem. 276: 32056—32063. PMID 11350955 DOI:10.1074/jbc.M011629200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tu Y.T., Barrientos A. (2015). The human mitochondrial DEAD-box protein DDX28 resides in RNA granules and functions in mitoribosome assembly. Cell Rep.: —. PMID 25683708 DOI:10.1016/j.celrep.2015.01.033
• Antonicka H., Shoubridge E.A. (2015). Mitochondrial RNA granules are centers for posttranscriptional RNA processing and ribosome biogenesis. Cell Rep.: —. PMID 25683715 DOI:10.1016/j.celrep.2015.01.030

Див. також

• Хромосома 16