DDX50

DDX50
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E29
Ідентифікатори
Символи	DDX50, GU2, GUB, RH-II/GuB, mcdrh, DEAD-box helicase 50, DExD-box helicase 50
Зовнішні ІД	OMIM: 610373 MGI: 2182303 HomoloGene: 56986 GeneCards: DDX50
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • RNA secondary structure unwinding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79009	94213
Ensembl	ENSG00000107625	ENSMUSG00000020076
UniProt	Q9BQ39	Q99MJ9
RefSeq (мРНК)	NM_024045	NM_053183 NM_001358819 NM_001358820
RefSeq (білок)	NP_076950	NP_444413 NP_001345748 NP_001345749
Локус (UCSC)	Хр. 10: 68.9 – 68.95 Mb	Хр. 10: 62.45 – 62.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX50 (англ. DExD-box helicase 50) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 737 амінокислот, а молекулярна маса — 82 565.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGKLLWGDI		MELEAPLEES		ESQKKERQKS		DRRKSRHHYD		SDEKSETREN
GVTDDLDAPK		AKKSKMKEKL		NGDTEEGFNR		LSDEFSKSHK		SRRKDLPNGD
IDEYEKKSKR		VSSLDTSTHK		SSDNKLEETL		TREQKEGAFS		NFPISEETIK
LLKGRGVTYL		FPIQVKTFGP		VYEGKDLIAQ		ARTGTGKTFS		FAIPLIERLQ
RNQETIKKSR		SPKVLVLAPT		RELANQVAKD		FKDITRKLSV		ACFYGGTSYQ
SQINHIRNGI		DILVGTPGRI		KDHLQSGRLD		LSKLRHVVLD		EVDQMLDLGF
AEQVEDIIHE		SYKTDSEDNP		QTLLFSATCP		QWVYKVAKKY		MKSRYEQVDL
VGKMTQKAAT		TVEHLAIQCH		WSQRPAVIGD		VLQVYSGSEG		RAIIFCETKK
NVTEMAMNPH		IKQNAQCLHG		DIAQSQREIT		LKGFREGSFK		VLVATNVAAR
GLDIPEVDLV		IQSSPPQDVE		SYIHRSGRTG		RAGRTGICIC		FYQPRERGQL
RYVEQKAGIT		FKRVGVPSTM		DLVKSKSMDA		IRSLASVSYA		AVDFFRPSAQ
RLIEEKGAVD		ALAAALAHIS		GASSFEPRSL		ITSDKGFVTM		TLESLEEIQD
VSCAWKELNR		KLSSNAVSQI		TRMCLLKGNM		GVCFDVPTTE		SERLQAEWHD
SDWILSVPAK		LPEIEEYYDG		NTSSNSRQRS		GWSSGRSGRS		GRSGGRSGGR
SGRQSRQGSR		SGSRQDGRRR		SGNRNRSRSG		GHKRSFD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Valdez B.C., Yang H., Hong E., Sequitin A.M. (2002). Genomic structure of newly identified paralogue of RNA helicase II/Gu: detection of pseudogenes and multiple alternatively spliced mRNAs. Gene. 284: 53—61. PMID 11891046 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00888-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10