DDX52

DDX52
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3DKP
Ідентифікатори
Символи	DDX52, HUSSY19, ROK1, DEAD-box helicase 52, DExD-box helicase 52
Зовнішні ІД	OMIM: 612500 MGI: 1925644 HomoloGene: 5093 GeneCards: DDX52
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • RNA secondary structure unwinding • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11056	78394
Ensembl	ENSG00000277594 ENSG00000278053	ENSMUSG00000020677
UniProt	Q9Y2R4	Q8K301
RefSeq (мРНК)	NM_001291476 NM_007010 NM_152300	NM_030096
RefSeq (білок)	NP_001278405 NP_008941	NP_084372
Локус (UCSC)	Хр. 17: 37.61 – 37.64 Mb	Хр. 11: 83.83 – 83.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX52 (англ. DExD-box helicase 52) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 599 амінокислот, а молекулярна маса — 67 498.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDVHDLFRRL		GAGAKFDTRR		FSADAARFQI		GKRKYDFDSS		EVLQGLDFFG
NKKSVPGVCG		ASQTHQKPQN		GEKKEESLTE		RKREQSKKKR		KTMTSEIASQ
EEGATIQWMS		SVEAKIEDKK		VQRESKLTSG		KLENLRKEKI		NFLRNKHKIH
VQGTDLPDPI		ATFQQLDQEY		KINSRLLQNI		LDAGFQMPTP		IQMQAIPVML
HGRELLASAP		TGSGKTLAFS		IPILMQLKQP		ANKGFRALII		SPTRELASQI
HRELIKISEG		TGFRIHMIHK		AAVAAKKFGP		KSSKKFDILV		TTPNRLIYLL
KQDPPGIDLA		SVEWLVVDES		DKLFEDGKTG		FRDQLASIFL		ACTSHKVRRA
MFSATFAYDV		EQWCKLNLDN		VISVSIGARN		SAVETVEQEL		LFVGSETGKL
LAMRELVKKG		FNPPVLVFVQ		SIERAKELFH		ELIYEGINVD		VIHAERTQQQ
RDNTVHSFRA		GKIWVLICTA		LLARGIDFKG		VNLVINYDFP		TSSVEYIHRI
GRTGRAGNKG		KAITFFTEDD		KPLLRSVANV		IQQAGCPVPE		YIKGFQKLLS
KQKKKMIKKP		LERESISTTP		KCFLEKAKDK		QKKVTGQNSK		KKVALEDKS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17