DDX60

DDX60
Ідентифікатори
Символи	DDX60, DExD/H-box helicase 60
Зовнішні ІД	OMIM: 613974 MGI: 2384570 HomoloGene: 23031 GeneCards: DDX60
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • double-stranded RNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • intermediate filament cytoskeleton • гіалоплазма Біологічний процес • response to virus • positive regulation of RIG-I signaling pathway • вроджений імунітет • defense response to virus • positive regulation of MDA-5 signaling pathway • процес імунної системи Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55601	234311
Ensembl	ENSG00000137628	ENSMUSG00000037921
UniProt	Q8IY21	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_017631	NM_001081215 NM_001293783 NM_144928
RefSeq (білок)	NP_060101	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 4: 168.22 – 168.32 Mb	Хр. 8: 62.38 – 62.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX60 (англ. DExD/H-box helicase 60) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 712 амінокислот, а молекулярна маса — 197 853.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERNVLTTFS		QEMSQLILNE		MPKAEYSSLF		NDFVESEFFL		IDGDSLLITC
ICEISFKPGQ		NLHFFYLVER		YLVDLISKGG		QFTIVFFKDA		EYAYFNFPEL
LSLRTALILH		LQKNTTIDVR		TTFSRCLSKE		WGSFLEESYP		YFLIVADEGL
NDLQTQLFNF		LIIHSWARKV		NVVLSSGQES		DVLCLYAYLL		PSMYRHQIFS
WKNKQNIKDA		YTTLLNQLER		FKLSALAPLF		GSLKWNNITE		EAHKTVSLLT
QVWPEGSDIR		RVFCVTSCSL		SLRMYHRFLG		NREPSSGQET		EIQQVNSNCL
TLQEMEDLCK		LHCLTVVFLL		HLPLSQRACA		RVITSHWAED		MKPLLQMKKW
CEYFILRNIH		TFEFWNLNLI		HLSDLNDELL		LKNIAFYYEN		ENVKGLHLNL
GDTIMKDYEY		LWNTVSKLVR		DFEVGQPFPL		RTTKVCFLEK		KPSPIKDSSN
EMVPNLGFIP		TSSFVVDKFA		GDILKDLPFL		KSDDPIVTSL		VKQKEFDELV
HWHSHKPLSD		DYDRSRCQFD		EKSRDPRVLR		SVQKYHVFQR		FYGNSLETVS
SKIIVTQTIK		SKKDFSGPKS		KKAHETKAEI		IARENKKRLF		AREEQKEEQK
WNALSFSIEE		QLKENLHSGI		KSLEDFLKSC		KSSCVKLQVE		MVGLTACLKA
WKEHCRSEEG		KTTKDLSIAV		QVMKRIHSLM		EKYSELLQED		DRQLIARCLK
YLGFDELASS		LHPAQDAEND		VKVKKRNKYS		VGIGPARFQL		QYMGHYLIRD
ERKDPDPRVQ		DFIPDTWQRE		LLDVVDKNES		AVIVAPTSSG		KTYASYYCME
KVLKESDDGV		VVYVAPTKAL		VNQVAATVQN		RFTKNLPSGE		VLCGVFTREY
RHDALNCQVL		ITVPACFEIL		LLAPHRQNWV		KKIRYVIFDE		VHCLGGEIGA
EIWEHLLVMI		RCPFLALSAT		ISNPEHLTEW		LQSVKWYWKQ		EDKIIENNTA
SKRHVGRQAG		FPKDYLQVKQ		SYKVRLVLYG		ERYNDLEKHV		CSIKHGDIHF
DHFHPCAALT		TDHIERYGFP		PDLTLSPRES		IQLYDAMFQI		WKSWPRAQEL
CPENFIHFNN		KLVIKKMDAR		KYEESLKAEL		TSWIKNGNVE		QARMVLQNLS
PEADLSPENM		ITMFPLLVEK		LRKMEKLPAL		FFLFKLGAVE		NAAESVSTFL
KKKQETKRPP		KADKEAHVMA		NKLRKVKKSI		EKQKIIDEKS		QKKTRNVDQS
LIHEAEHDNL		VKCLEKNLEI		PQDCTYADQK		AVDTETLQKV		FGRVKFERKG
EELKALAERG		IGYHHSAMSF		KEKQLVEILF		RKGYLRVVTA		TGTLALGVNM
PCKSVVFAQN		SVYLDALNYR		QMSGRAGRRG		QDLMGDVYFF		DIPFPKIGKL
IKSNVPELRG		HFPLSITLVL		RLMLLASKGD		DPEDAKAKVL		SVLKHSLLSF
KQPRVMDMLK		LYFLFSLQFL		VKEGYLDQEG		NPMGFAGLVS		HLHYHEPSNL
VFVSFLVNGL		FHDLCQPTRK		GSKHFSQDVM		EKLVLVLAHL		FGRRYFPPKF
QDAHFEFYQS		KVFLDDLPED		FSDALDEYNM		KIMEDFTTFL		RIVSKLADMN
QEYQLPLSKI		KFTGKECEDS		QLVSHLMSCK		EGRVAISPFV		CLSGNFDDDL
LRLETPNHVT		LGTIGVNRSQ		APVLLSQKFD		NRGRKMSLNA		YALDFYKHGS
LIGLVQDNRM		NEGDAYYLLK		DFALTIKSIS		VSLRELCENE		DDNVVLAFEQ
LSTTFWEKLN		KV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Miyashita M., Oshiumi H., Matsumoto M., Seya T. (2011). DDX60, a DEXD/H box helicase, is a novel antiviral factor promoting RIG-I-like receptor-mediated signaling. Mol. Cell. Biol. 31: 3802—3819. PMID 21791617 DOI:10.1128/MCB.01368-10

Див. також

• Хромосома 4