DMAP1

DMAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3HM5, 4IEJ
Ідентифікатори
Символи	DMAP1, DNMAP1, DNMTAP1, EAF2, MEAF2, SWC4, DNA methyltransferase 1 associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605077 MGI: 1913483 HomoloGene: 41311 GeneCards: DMAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding Клітинна компонента • replication fork • цитоплазма • NuA4 histone acetyltransferase complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • Ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • Метилювання ДНК • regulation of growth • response to ethanol • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone H4 acetylation • histone H2A acetylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of protein import into nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55929	66233
Ensembl	ENSG00000178028	ENSMUSG00000009640
UniProt	Q9NPF5 Q5TG37	Q9JI44
RefSeq (мРНК)	NM_001034023 NM_001034024 NM_019100	NM_023178
RefSeq (білок)	NP_001029195 NP_001029196 NP_061973	NP_075667
Локус (UCSC)	Хр. 1: 44.21 – 44.22 Mb	Хр. 4: 117.53 – 117.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DMAP1 (англ. DNA methyltransferase 1 associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 993.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATGADVRDI		LELGGPEGDA		ASGTISKKDI		INPDKKKSKK		SSETLTFKRP
EGMHREVYAL		LYSDKKDAPP		LLPSDTGQGY		RTVKAKLGSK		KVRPWKWMPF
TNPARKDGAM		FFHWRRAAEE		GKDYPFARFN		KTVQVPVYSE		QEYQLYLHDD
AWTKAETDHL		FDLSRRFDLR		FVVIHDRYDH		QQFKKRSVED		LKERYYHICA
KLANVRAVPG		TDLKIPVFDA		GHERRRKEQL		ERLYNRTPEQ		VAEEEYLLQE
LRKIEARKKE		REKRSQDLQK		LITAADTTAE		QRRTERKAPK		KKLPQKKEAE
KPAVPETAGI		KFPDFKSAGV		TLRSQRMKLP		SSVGQKKIKA		LEQMLLELGV
ELSPTPTEEL		VHMFNELRSD		LVLLYELKQA		CANCEYELQM		LRHRHEALAR
AGVLGGPATP		ASGPGPASAE		PAVTEPGLGP		DPKDTIIDVV		GAPLTPNSRK
RRESASSSSS		VKKAKKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, регуляція росту. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Rountree M.R., Bachman K.E., Baylin S.B. (2000). DNMT1 binds HDAC2 and a new co-repressor, DMAP1, to form a complex at replication foci. Nat. Genet. 25: 269—277. PMID 10888872 DOI:10.1038/77023
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Doyon Y., Cote J. (2004). The highly conserved and multifunctional NuA4 HAT complex. Curr. Opin. Genet. Dev. 14: 147—154. PMID 15196461 DOI:10.1016/j.gde.2004.02.009
• Xin H., Yoon H.-G., Singh P.B., Wong J., Qin J. (2004). Components of a pathway maintaining histone modification and heterochromatin protein 1 binding at the pericentric heterochromatin in mammalian cells. J. Biol. Chem. 279: 9539—9546. PMID 14665632 DOI:10.1074/jbc.M311587200
• Doyon Y., Selleck W., Lane W.S., Tan S., Cote J. (2004). Structural and functional conservation of the NuA4 histone acetyltransferase complex from yeast to humans. Mol. Cell. Biol. 24: 1884—1896. PMID 14966270 DOI:10.1128/MCB.24.5.1884-1896.2004

Див. також

• Хромосома 1