DMRT2

DMRT2
Ідентифікатори
Символи	DMRT2, doublesex and mab-3 related transcription factor 2, DSXL-2
Зовнішні ІД	OMIM: 604935 MGI: 1330307 HomoloGene: 17111 GeneCards: DMRT2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein homodimerization activity • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • компонент клітини • integral component of membrane • мембрана Біологічний процес • positive regulation of myotome development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of somitogenesis • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic skeletal system development • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10655	226049
Ensembl	ENSG00000173253	ENSMUSG00000048138
UniProt	Q9Y5R5 Q05C20	Q8BG36
RefSeq (мРНК)	NM_001130865 NM_006557 NM_181872 NM_001370531 NM_001370532 NM_001370533 NM_001387557 NM_001387558 NM_001387559 NM_001387560	NM_145831
RefSeq (білок)	NP_001124337 NP_006548 NP_870987 NP_001357460 NP_001357461 NP_001357462 NP_001124337.1 NP_006548.1 NP_870987.2	NP_665830
Локус (UCSC)	Хр. 9: 1.05 – 1.06 Mb	Хр. 19: 25.65 – 25.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DMRT2 (англ. Doublesex and mab-3 related transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 561 амінокислот, а молекулярна маса — 61 814.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADPQAGSAA		GDWEIDVESL		ELEEDVCGAP		RSTPPGPSPP		PADGDCEDDE
DDDGVDEDAE		EEGDGEEAGA		SPGMPGQPEQ		RGGPQPRPPL		APQASPAGTG
PRERCTPAGG		GAEPRKLSRT		PKCARCRNHG		VVSCLKGHKR		FCRWRDCQCA
NCLLVVERQR		VMAAQVALRR		QQATEDKKGL		SGKQNNFERK		AVYQRQVRAP
SLLAKSILEG		YRPIPAETYV		GGTFPLPPPV		SDRMRKRRAF		ADKELENIML
EREYKEREML		ETSQAAALFL		PNRMVPGPDY		NSYKSAYSPS		PVEPPSKDFC
NFLPTCLDLT		MQYSGSGNME		LISSNVSVAT		TYRQYPLSSR		FLVWPKCGPI
SDTLLYQQCL		LNATTSVQAL		KPGASWDLKG		ARVQDGLSAE		QDMMPSKLEG
SLVLPHTPEI		QTTRSDLQGH		QAVPERSAFS		PPRRNFSPIV		DTDSLAAQGH
VLTKISKENT		RHPLPLRHNP		FHSLFQQTLT		DKSGPELKTP		FVKEAFEETP
KKHRECLVKD		NQKYTFTIDR		CAKDLFVAKQ		VGTKLSVNEP		LSFSVESILK
RPSSAITRVS		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Ottolenghi C., Veitia R., Barbieri M., Fellous M., McElreavey K. (2000). The human doublesex-related gene, DMRT2, is homologous to a gene involved in somitogenesis and encodes a potential bicistronic transcript. Genomics. 64: 179—186. PMID 10729224 DOI:10.1006/geno.2000.6120
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9