DPF1

DPF1
Ідентифікатори
Символи	DPF1, BAF45b, NEUD4, neuro-d4, double PHD fingers 1, SMARCG1
Зовнішні ІД	OMIM: 601670 MGI: 1352748 HomoloGene: 3415 GeneCards: DPF1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding • histone acetyltransferase activity • GO:0031493 histone binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • nBAF complex • клітинне ядро • histone acetyltransferase complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0097285 апоптоз • histone acetylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8193	29861
Ensembl	ENSG00000011332	ENSMUSG00000030584
UniProt	Q92782 Q6PJ73	Q9QX66
RefSeq (мРНК)	NM_001135155 NM_001135156 NM_001289978 NM_004647 NM_001363579	NM_013874 NM_001368371
RefSeq (білок)	NP_001128627 NP_001128628 NP_001276907 NP_004638 NP_001350508 NP_001128628.1	NP_038902 NP_001355300 NP_001390134 NP_001390135 NP_001390136 NP_001390137 NP_001390138 NP_001390140 NP_001390141 NP_001390143 NP_001390144 NP_001390145 NP_001390146 NP_001390147 NP_001390148 NP_001390149 NP_001390139
Локус (UCSC)	Хр. 19: 38.21 – 38.23 Mb	Хр. 7: 29.3 – 29.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DPF1 (англ. Double PHD fingers 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 42 502.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGLSARPTA		GRTDPAGTCW		GQDPGSKMAT		VIPGPLSLGE		DFYREAIEHC
RSYNARLCAE		RSLRLPFLDS		QTGVAQNNCY		IWMEKTHRGP		GLAPGQIYTY
PARCWRKKRR		LNILEDPRLR		PCEYKIDCEA		PLKKEGGLPE		GPVLEALLCA
ETGEKKIELK		EEETIMDCQK		QQLLEFPHDL		EVEDLEDDIP		RRKNRAKGKA
YGIGGLRKRQ		DTASLEDRDK		PYVCDKFYKE		LAWVPEAQRK		HTAKKAPDGT
VIPNGYCDFC		LGGSKKTGCP		EDLISCADCG		RSGHPSCLQF		TVNMTAAVRT
YRWQCIECKS		CSLCGTSEND		GASWAGLTPQ		DQLLFCDDCD		RGYHMYCLSP
PMAEPPEGSW		SCHLCLRHLK		EKASAYITLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chestkov A.V., Baka I.D., Kost M.V., Georgiev G.P., Buchman V.L. (1996). The d4 gene family in the human genome. Genomics. 36: 174—177. PMID 8812431 DOI:10.1006/geno.1996.0440

Див. також

• Хромосома 19