DPF2

DPF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3IUF
Ідентифікатори
Символи	DPF2, REQ, UBID4, ubi-d4, double PHD fingers 2, CSS7, SMARCG2
Зовнішні ІД	OMIM: 601671 MGI: 109529 HomoloGene: 21265 GeneCards: DPF2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone acetyltransferase activity • GO:0031493 histone binding • H3K9me3 modified histone binding • lysine-acetylated histone binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • центросома • цитоплазма • гіалоплазма • histone acetyltransferase complex • nBAF complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • apoptotic signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • нейробіологія розвитку • histone acetylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of myeloid progenitor cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5977	19708
Ensembl	ENSG00000133884	ENSMUSG00000024826
UniProt	Q92785	Q61103
RefSeq (мРНК)	NM_006268 NM_001330308	NM_001291078 NM_011262
RefSeq (білок)	NP_001317237 NP_006259 NP_006259.1	NP_001278007 NP_035392
Локус (UCSC)	Хр. 11: 65.33 – 65.35 Mb	Хр. 19: 5.95 – 5.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DPF2 (англ. Double PHD fingers 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 44 155.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVVENVVK		LLGEQYYKDA		MEQCHNYNAR		LCAERSVRLP		FLDSQTGVAQ
SNCYIWMEKR		HRGPGLASGQ		LYSYPARRWR		KKRRAHPPED		PRLSFPSIKP
DTDQTLKKEG		LISQDGSSLE		ALLRTDPLEK		RGAPDPRVDD		DSLGEFPVTN
SRARKRILEP		DDFLDDLDDE		DYEEDTPKRR		GKGKSKGKGV		GSARKKLDAS
ILEDRDKPYA		CDICGKRYKN		RPGLSYHYAH		SHLAEEEGED		KEDSQPPTPV
SQRSEEQKSK		KGPDGLALPN		NYCDFCLGDS		KINKKTGQPE		ELVSCSDCGR
SGHPSCLQFT		PVMMAAVKTY		RWQCIECKCC		NICGTSENDD		QLLFCDDCDR
GYHMYCLTPS		MSEPPEGSWS		CHLCLDLLKE		KASIYQNQNS		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chestkov A.V., Baka I.D., Kost M.V., Georgiev G.P., Buchman V.L. (1996). The d4 gene family in the human genome. Genomics. 36: 174—177. PMID 8812431 DOI:10.1006/geno.1996.0440
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 11