EBF4

EBF4
Ідентифікатори
Символи	EBF4, COE4, O/E-4, early B-cell factor 4, early B cell factor 4, EBF family member 4, OE-4
Зовнішні ІД	OMIM: 609935 MGI: 2385972 HomoloGene: 65064 GeneCards: EBF4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57593	228598
Ensembl	ENSG00000088881	ENSMUSG00000053552
UniProt	Q9BQW3	Q8K4J2
RefSeq (мРНК)	NM_001110514 NM_020833 NM_001395167 NM_001395168	NM_001110513 NM_152993
RefSeq (білок)	NP_001103984	NP_001103983
Локус (UCSC)	Хр. 20: 2.69 – 2.76 Mb	Хр. 2: 130.14 – 130.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EBF4 (англ. Early B-cell factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 602 амінокислот, а молекулярна маса — 64 473.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFPAQDALPR		SGLNLKEEPL		LPAGLGSVRS		WMQGAGILDA		STAAQSGVGL
ARAHFEKQPP		SNLRKSNFFH		FVLAMYDRQG		QPVEVERTAF		IDFVEKDREP
GAEKTNNGIH		YRLRLVYNNG		LRTEQDLYVR		LIDSMSKQAI		IYEGQDKNPE
MCRVLLTHEI		MCSRCCDRKS		CGNRNETPSD		PVIIDRFFLK		FFLKCNQNCL
KNAGNPRDMR		RFQVVVSTTV		SVDGHVLAVS		DNMFVHNNSK		HGRRARRLDP
SEAATPCIKA		ISPGEGWTTG		GATVIVIGDN		FFDGLQVVFG		NVLVWSELIT
PHAIRVQTPP		RHIPGVVEVT		LSYKSKQFCK		GCPGRFVYTA		LNEPTIDYGF
QRLQKVIPRH		PGDPERLPKE		VLLKRAADLA		EALYGVPGSN		QELLLKRAAD
VAEALYSTPR		APGPLAPLAP		SHPHPAVVGI		NAFSSPLAIA		VGDATPGPEP
GYARSCSSAS		PRGFAPSPGS		QQSGYGGGLG		AGLGGYGAPG		VAGLGVPGSP
SFLNGSTATS		PFAIMPSSPP		LAAASSMSLP		AAAPTTSVFS		FSPVNMISAV
KQRSAFAPVL		RPPSSPPQAC		PRAHGEGLPD		QSFEDSDKFH		SPARGLQGLA
YS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Див. також

• Хромосома 20