EDF1

EDF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X57
Ідентифікатори
Символи	EDF1, EDF-1, MBF1, CFAP280, endothelial differentiation related factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605107 MGI: 1891227 HomoloGene: 2809 GeneCards: EDF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • calmodulin binding • histone acetyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • TFIID-class transcription factor complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • transcription factor TFIID complex • внутрішньоклітинний • ядерце • екзосома • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of lipid metabolic process • endothelial cell differentiation • positive regulation of DNA binding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8721	59022
Ensembl	ENSG00000107223	ENSMUSG00000015092
UniProt	O60869	Q9JMG1
RefSeq (мРНК)	NM_153200 NM_001281297 NM_001281298 NM_001281299 NM_003792	NM_021519
RefSeq (білок)	NP_001268226 NP_001268227 NP_001268228 NP_003783 NP_694880	NP_067494
Локус (UCSC)	Хр. 9: 136.86 – 136.87 Mb	Хр. 2: 25.45 – 25.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EDF1 (англ. Endothelial differentiation related factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 148 амінокислот, а молекулярна маса — 16 369.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAESDWDTVT		VLRKKGPTAA		QAKSKQAILA		AQRRGEDVET		SKKWAAGQNK
QHSITKNTAK		LDRETEELHH		DRVTLEVGKV		IQQGRQSKGL		TQKDLATKIN
EKPQVIADYE		SGRAIPNNQV		LGKIERAIGL		KLRGKDIGKP		IEKGPRAK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Dragoni I., Mariotti M., Consalez G.G., Soria M.R., Maier J.A.M. (1998). EDF-1, a novel gene product down-regulated in human endothelial cell differentiation. J. Biol. Chem. 273: 31119—31124. PMID 9813014 DOI:10.1074/jbc.273.47.31119
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mariotti M., De Benedictis L., Avon E., Maier J.A.M. (2000). Interaction between endothelial differentiation-related factor-1 and calmodulin in vitro and in vivo. J. Biol. Chem. 275: 24047—24051. PMID 10816571 DOI:10.1074/jbc.M001928200
• Brendel C., Gelman L., Auwerx J. (2002). Multiprotein bridging factor-1 (MBF-1) is a cofactor for nuclear receptors that regulate lipid metabolism. Mol. Endocrinol. 16: 1367—1377. PMID 12040021 DOI:10.1210/mend.16.6.0843
• Ballabio E., Mariotti M., De Benedictis L., Maier J.A.M. (2004). The dual role of endothelial differentiation-related factor-1 in the cytosol and nucleus: modulation by protein kinase A. Cell. Mol. Life Sci. 61: 1069—1074. PMID 15112053 DOI:10.1007/s00018-004-4016-0

Див. також

• Хромосома 9