EED

EED
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3IIW, 3IIY, 3IJ0, 3IJ1, 3IJC, 3JPX, 3JZG, 3JZH, 3JZN, 3K26, 3K27, 4X3E, 5IJ7, 5IJ8, 5HYN
Ідентифікатори
Символи	EED, HWAIT1, embryonic ectoderm development, COGIS
Зовнішні ІД	OMIM: 605984 MGI: 95286 HomoloGene: 2814 GeneCards: EED
Онтологія гена Молекулярна функція • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • histone methyltransferase activity • histone methyltransferase activity (H3-K27 specific) • nucleosome binding Клітинна компонента • sex chromatin • ESC/E(Z) complex • хромосома • Пронуклеус • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of gene expression by genetic imprinting • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression, epigenetic • spinal cord development • positive regulation of histone H3-K27 methylation • histone methylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of adaxial/abaxial pattern formation • histone H3-K27 methylation • cellular response to leukemia inhibitory factor • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8726	13626
Ensembl	ENSG00000074266	ENSMUSG00000030619
UniProt	O75530	Q921E6
RefSeq (мРНК)	NM_001308007 NM_003797 NM_152991 NM_001330334	NM_021876
RefSeq (білок)	NP_001294936 NP_001317263 NP_003788	NP_068676
Локус (UCSC)	Хр. 11: 86.24 – 86.28 Mb	Хр. 7: 89.6 – 89.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EED (англ. Embryonic ectoderm development) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 50 198.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSEREVSTAP		AGTDMPAAKK		QKLSSDENSN		PDLSGDENDD		AVSIESGTNT
ERPDTPTNTP		NAPGRKSWGK		GKWKSKKCKY		SFKCVNSLKE		DHNQPLFGVQ
FNWHSKEGDP		LVFATVGSNR		VTLYECHSQG		EIRLLQSYVD		ADADENFYTC
AWTYDSNTSH		PLLAVAGSRG		IIRIINPITM		QCIKHYVGHG		NAINELKFHP
RDPNLLLSVS		KDHALRLWNI		QTDTLVAIFG		GVEGHRDEVL		SADYDLLGEK
IMSCGMDHSL		KLWRINSKRM		MNAIKESYDY		NPNKTNRPFI		SQKIHFPDFS
TRDIHRNYVD		CVRWLGDLIL		SKSCENAIVC		WKPGKMEDDI		DKIKPSESNV
TILGRFDYSQ		CDIWYMRFSM		DFWQKMLALG		NQVGKLYVWD		LEVEDPHKAK
CTTLTHHKCG		AAIRQTSFSR		DSSILIAVCD		DASIWRWDRL		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Schumacher A., Lichtarge O., Schwartz S., Magnuson T. (1998). The murine Polycomb-group gene eed and its human orthologue: functional implications of evolutionary conservation. Genomics. 54: 79—88. PMID 9806832 DOI:10.1006/geno.1998.5509
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rietzler M., Bittner M., Kolanus W., Schuster A., Holzmann B. (1998). The human WD repeat protein WAIT-1 specifically interacts with the cytoplasmic tails of beta7-integrins. J. Biol. Chem. 273: 27459—27466. PMID 9765275 DOI:10.1074/jbc.273.42.27459
• van der Vlag J., Otte A.P. (1999). Transcriptional repression mediated by the human polycomb-group protein EED involves histone deacetylation. Nat. Genet. 23: 474—478. PMID 10581039 DOI:10.1038/70602
• Satijn D.P.E., Hamer K.M., den Blaauwen J., Otte A.P. (2001). The polycomb group protein EED interacts with YY1, and both proteins induce neural tissue in Xenopus embryos. Mol. Cell. Biol. 21: 1360—1369. PMID 11158321 DOI:10.1128/MCB.21.4.1360-1369.2001
• Kuzmichev A., Nishioka K., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. (2002). Histone methyltransferase activity associated with a human multiprotein complex containing the Enhancer of Zeste protein. Genes Dev. 16: 2893—2905. PMID 12435631 DOI:10.1101/gad.1035902

Див. також

• Хромосома 11