ELOB

ELOB
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1LM8, 1LQB, 1VCB, 2C9W, 2IZV, 2JZ3, 2MA9, 3DCG, 3ZKJ, 3ZNG, 3ZRC, 3ZRF, 3ZTC, 3ZTD, 3ZUN, 4AJY, 4AWJ, 4B95, 4B9K, 4BKS, 4BKT, 4N9F, 4W9C, 4W9D, 4W9E, 4W9F, 4W9G, 4W9H, 4W9I, 4W9J, 4W9K, 4W9L, 4WQO, 5BO4
Ідентифікатори
Символи	ELOB, SIII, TCEB2, transcription elongation factor B subunit 2, elongin B
Зовнішні ІД	OMIM: 600787 HomoloGene: 134544 GeneCards: ELOB
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • Cul2-RING ubiquitin ligase complex • гіалоплазма • Cul5-RING ubiquitin ligase complex • VCB complex • клітинне ядро • elongin complex • нуклеоплазма Біологічний процес • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • Убіквітин-залежний протеоліз • посттрансляційна модифікація • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6923	100909963
Ensembl	ENSG00000103363	н/д
UniProt	Q15370	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_207013 NM_007108	XM_039082858
RefSeq (білок)	NP_009039 NP_996896	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 16: 2.77 – 2.78 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ELOB (англ. Elongin B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 118 амінокислот, а молекулярна маса — 13 133.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDVFLMIRRH		KTTIFTDAKE		SSTVFELKRI		VEGILKRPPD		EQRLYKDDQL
LDDGKTLGEC		GFTSQTARPQ		APATVGLAFR		ADDTFEALCI		EPFSSPPELP
DVMKPQDSGS		SANEQAVQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aso T., Yamazaki K., Aigaki T., Kitajima S. (2000). Drosophila von Hippel-Lindau tumor suppressor complex possesses E3 ubiquitin ligase activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 276: 355—361. PMID 11006129 DOI:10.1006/bbrc.2000.3451
• Mehle A., Goncalves J., Santa-Marta M., McPike M., Gabuzda D. (2004). Phosphorylation of a novel SOCS-box regulates assembly of the HIV-1 Vif-Cul5 complex that promotes APOBEC3G degradation. Genes Dev. 18: 2861—2866. PMID 15574592 DOI:10.1101/gad.1249904
• Woo J.S., Suh H.Y., Park S.Y., Oh B.H. (2006). Structural basis for protein recognition by B30.2/SPRY domains. Mol. Cell. 24: 967—976. PMID 17189197 DOI:10.1016/j.molcel.2006.11.009
• Stebbins C.E., Kaelin W.G. Jr., Pavletich N.P. (1999). Structure of the VHL-ElonginC-ElonginB complex: implications for VHL tumor suppressor function. Science. 284: 455—461. PMID 10205047 DOI:10.1126/science.284.5413.455
• Bullock A.N., Rodriguez M.C., Debreczeni J.E., Songyang Z., Knapp S. (2007). Structure of the SOCS4-ElonginB/C complex reveals a distinct SOCS box interface and the molecular basis for SOCS-dependent EGFR degradation. Structure. 15: 1493—1504. PMID 17997974 DOI:10.1016/j.str.2007.09.016

Див. також

• Хромосома 16