EP400

EP400
Ідентифікатори
Символи	EP400, CAGH32, P400, TNRC12, E1A binding protein p400
Зовнішні ІД	OMIM: 606265 MGI: 1276124 HomoloGene: 38779 GeneCards: EP400
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • protein antigen binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • hydrolase activity • GO:0008026 helicase activity Клітинна компонента • NuA4 histone acetyltransferase complex • nuclear speck • клітинне ядро • Swr1 complex • нуклеоплазма Біологічний процес • histone H2A acetylation • histone H4 acetylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57634	75560
Ensembl	ENSG00000183495	ENSMUSG00000029505
UniProt	Q96L91	Q8CHI8
RefSeq (мРНК)	NM_015409	NM_029337 NM_173066
RefSeq (білок)	NP_056224	NP_083613 NP_775089
Локус (UCSC)	Хр. 12: 131.95 – 132.08 Mb	Хр. 5: 110.81 – 110.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EP400 (англ. E1A binding protein p400) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 159 амінокислот, а молекулярна маса — 343 489.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHHGTGPQNV		QHQLQRSRAC		PGSEGEEQPA		HPNPPPSPAA		PFAPSASPSA
PQSPSYQIQQ		LMNRSPATGQ		NVNITLQSVG		PVVGGNQQIT		LAPLPLPSPT
SPGFQFSAQP		RRFEHGSPSY		IQVTSPLSQQ		VQTQSPTQPS		PGPGQALQNV
RAGAPGPGLG		LCSSSPTGGF		VDASVLVRQI		SLSPSSGGHF		VFQDGSGLTQ
IAQGAQVQLQ		HPGTPITVRE		RRPSQPHTQS		GGTIHHLGPQ		SPAAAGGAGL
QPLASPSHIT		TANLPPQISS		IIQGQLVQQQ		QVLQGPPLPR		PLGFERTPGV
LLPGAGGAAG		FGMTSPPPPT		SPSRTAVPPG		LSSLPLTSVG		NTGMKKVPKK
LEEIPPASPE		MAQMRKQCLD		YHYQEMQALK		EVFKEYLIEL		FFLQHFQGNM
MDFLAFKKKH		YAPLQAYLRQ		NDLDIEEEEE		EEEEEEEKSE		VINDEVKVVT
GKDGQTGTPV		AIATQLPPKV		SAAFSSQQQP		FQQALAGSLV		AGAGSTVETD
LFKRQQAMPS		TGMAEQSKRP		RLEVGHQGVV		FQHPGADAGV		PLQQLMPTAQ
GGMPPTPQAA		QLAGQRQSQQ		QYDPSTGPPV		QNAASLHTPL		PQLPGRLPPA
GVPTAALSSA		LQFAQQPQVV		EAQTQLQIPV		KTQQPNVPIP		APPSSQLPIP
PSQPAQLALH		VPTPGKVQVQ		ASQLSSLPQM		VASTRLPVDP		APPCPRPLPT
SSTSSLAPVS		GSGPGPSPAR		SSPVNRPSSA		TNKALSPVTS		RTPGVVASAP
TKPQSPAQNA		TSSQDSSQDT		LTEQITLENQ		VHQRIAELRK		AGLWSQRRLP
KLQEAPRPKS		HWDYLLEEMQ		WMATDFAQER		RWKVAAAKKL		VRTVVRHHEE
KQLREERGKK		EEQSRLRRIA		ASTAREIECF		WSNIEQVVEI		KLRVELEEKR
KKALNLQKVS		RRGKELRPKG		FDALQESSLD		SGMSGRKRKA		SISLTDDEVD
DEEETIEEEE		ANEGVVDHQT		ELSNLAKEAE		LPLLDLMKLY		EGAFLPSSQW
PRPKPDGEDT		SGEEDADDCP		GDRESRKDLV		LIDSLFIMDQ		FKAAERMNIG
KPNAKDIADV		TAVAEAILPK		GSARVTTSVK		FNAPSLLYGA		LRDYQKIGLD
WLAKLYRKNL		NGILADEAGL		GKTVQIIAFF		AHLACNEGNW		GPHLVVVRSC
NILKWELELK		RWCPGLKILS		YIGSHRELKA		KRQEWAEPNS		FHVCITSYTQ
FFRGLTAFTR		VRWKCLVIDE		MQRVKGMTER		HWEAVFTLQS		QQRLLLIDSP
LHNTFLELWT		MVHFLVPGIS		RPYLSSPLRA		PSEESQDYYH		KVVIRLHRVT
QPFILRRTKR		DVEKQLTKKY		EHVLKCRLSN		RQKALYEDVI		LQPGTQEALK
SGHFVNVLSI		LVRLQRICNH		PGLVEPRHPG		SSYVAGPLEY		PSASLILKAL
ERDFWKEADL		SMFDLIGLEN		KITRHEAELL		SKKKIPRKLM		EEISTSAAPA
ARPAAAKLKA		SRLFQPVQYG		QKPEGRTVAF		PSTHPPRTAA		PTTASAAPQG
PLRGRPPIAT		FSANPEAKAA		AAPFQTSQAS		ASAPRHQPAS		ASSTAASPAH
PAKLRAQTTA		QASTPGQPPP		QPQAPSHAAG		QSALPQRLVL		PSQAQARLPS
GEVVKIAQLA		SITGPQSRVA		QPETPVTLQF		QGSKFTLSHS		QLRQLTAGQP
LQLQGSVLQI		VSAPGQPYLR		APGPVVMQTV		SQAGAVHGAL		GSKPPAGGPS
PAPLTPQVGV		PGRVAVNALA		VGEPGTASKP		ASPIGGPTQE		EKTRLLKERL
DQIYLVNERR		CSQAPVYGRD		LLRICALPSH		GRVQWRGSLD		GRRGKEAGPA
HSYTSSSESP		SELMLTLCRC		GESLQDVIDR		VAFVIPPVVA		APPSLRVPRP
PPLYSHRMRI		LRQGLREHAA		PYFQQLRQTT		APRLLQFPEL		RLVQFDSGKL
EALAILLQKL		KSEGRRVLIL		SQMILMLDIL		EMFLNFHYLT		YVRIDENASS
EQRQELMRSF		NRDRRIFCAI		LSTHSRTTGI		NLVEADTVVF		YDNDLNPVMD
AKAQEWCDRI		GRCKDIHIYR		LVSGNSIEEK		LLKNGTKDLI		REVAAQGNDY
SMAFLTQRTI		QELFEVYSPM		DDAGFPVKAE		EFVVLSQEPS		VTETIAPKIA
RPFIEALKSI		EYLEEDAQKS		AQEGVLGPHT		DALSSDSENM		PCDEEPSQLE
ELADFMEQLT		PIEKYALNYL		ELFHTSIEQE		KERNSEDAVM		TAVRAWEFWN
LKTLQEREAR		LRLEQEEAEL		LTYTREDAYS		MEYVYEDVDG		QTEVMPLWTP
PTPPQDDSDI		YLDSVMCLMY		EATPIPEAKL		PPVYVRKERK		RHKTDPSAAG
RKKKQRHGEA		VVPPRSLFDR		ATPGLLKIRR		EGKEQKKNIL		LKQQVPFAKP
LPTFAKPTAE		PGQDNPEWLI		SEDWALLQAV		KQLLELPLNL		TIVSPAHTPN
WDLVSDVVNS		CSRIYRSSKQ		CRNRYENVII		PREEGKSKNN		RPLRTSQIYA
QDENATHTQL		YTSHFDLMKM		TAGKRSPPIK		PLLGMNPFQK		NPKHASVLAE
SGINYDKPLP		PIQVASLRAE		RIAKEKKALA		DQQKAQQPAV		AQPPPPQPQP
PPPPQQPPPP		LPQPQAAGSQ		PPAGPPAVQP		QPQPQPQTQP		QPVQAPAKAQ
PAITTGGSAA		VLAGTIKTSV		TGTSMPTGAV		SGNVIVNTIA		GVPAATFQSI
NKRLASPVAP		GALTTPGGSA		PAQVVHTQPP		PRAVGSPATA		TPDLVSMATT
QGVRAVTSVT		ASAVVTTNLT		PVQTPARSLV		PQVSQATGVQ		LPGKTITPAH
FQLLRQQQQQ		QQQQQQQQQQ		QQQQQQQQQQ		QQQQTTTTSQ		VQVPQIQGQA
QSPAQIKAVG		KLTPEHLIKM		QKQKLQMPPQ		PPPPQAQSAP		PQPTAQVQVQ
TSQPPQQQSP		QLTTVTAPRP		GALLTGTTVA		NLQVARLTRV		PTSQLQAQGQ
MQTQAPQPAQ		VALAKPPVVS		VPAAVVSSPG		VTTLPMNVAG		ISVAIGQPQK
AAGQTVVAQP		VHMQQLLKLK		QQAVQQQKAI		QPQAAQGPAA		VQQKITAQQI
TTPGAQQKVA		YAAQPALKTQ		FLTTPISQAQ		KLAGAQQVQT		QIQVAKLPQV
VQQQTPVASI		QQVASASQQA		SPQTVALTQA		TAAGQQVQMI		PAVTATAQVV
QQKLIQQQVV		TTASAPLQTP		GAPNPAQVPA		SSDSPSQQPK		LQMRVPAVRL
KTPTKPPCQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• Doyon Y., Cote J. (2004). The highly conserved and multifunctional NuA4 HAT complex. Curr. Opin. Genet. Dev. 14: 147—154. PMID 15196461 DOI:10.1016/j.gde.2004.02.009
• Doyon Y., Selleck W., Lane W.S., Tan S., Cote J. (2004). Structural and functional conservation of the NuA4 histone acetyltransferase complex from yeast to humans. Mol. Cell. Biol. 24: 1884—1896. PMID 14966270 DOI:10.1128/MCB.24.5.1884-1896.2004

Див. також

• Хромосома 12