EXO1

EXO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QE9, 3QEA, 3QEB
Ідентифікатори
Символи	EXO1, HEX1, hExoI, exonuclease 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606063 MGI: 1349427 HomoloGene: 31352 GeneCards: EXO1
Онтологія гена Молекулярна функція • endonuclease activity • double-stranded DNA 5'-3' exodeoxyribonuclease activity • single-stranded DNA 5'-3' exodeoxyribonuclease activity • DNA binding • 5'-3' exonuclease activity • nuclease activity • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 5'-3' exodeoxyribonuclease activity • flap endonuclease activity • chromatin binding • exonuclease activity • hydrolase activity, acting on ester bonds • каталітична активність • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • double-stranded DNA binding • 5'-flap endonuclease activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • клітинна мембрана Біологічний процес • DNA recombination • процес імунної системи • humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin • DNA mismatch repair • cellular response to DNA damage stimulus • somatic hypermutation of immunoglobulin genes • GO:0007126 мейоз • Перемикання класу імуноглобулінів • GO:0100026 Репарація ДНК • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • реплікація ДНК • t-circle formation • meiotic DNA double-strand break processing • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9156	26909
Ensembl	ENSG00000174371	ENSMUSG00000039748
UniProt	Q9UQ84 Q5T397	Q9QZ11
RefSeq (мРНК)	NM_003686 NM_006027 NM_130398 NM_001319224	NM_012012
RefSeq (білок)	NP_001306153 NP_003677 NP_006018 NP_569082	NP_036142
Локус (UCSC)	Хр. 1: 241.85 – 241.9 Mb	Хр. 1: 175.71 – 175.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EXO1 (англ. Exonuclease 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 846 амінокислот, а молекулярна маса — 94 103.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGIQGLLQFI		KEASEPIHVR		KYKGQVVAVD		TYCWLHKGAI		ACAEKLAKGE
PTDRYVGFCM		KFVNMLLSHG		IKPILVFDGC		TLPSKKEVER		SRRERRQANL
LKGKQLLREG		KVSEARECFT		RSINITHAMA		HKVIKAARSQ		GVDCLVAPYE
ADAQLAYLNK		AGIVQAIITE		DSDLLAFGCK		KVILKMDQFG		NGLEIDQARL
GMCRQLGDVF		TEEKFRYMCI		LSGCDYLSSL		RGIGLAKACK		VLRLANNPDI
VKVIKKIGHY		LKMNITVPED		YINGFIRANN		TFLYQLVFDP		IKRKLIPLNA
YEDDVDPETL		SYAGQYVDDS		IALQIALGNK		DINTFEQIDD		YNPDTAMPAH
SRSHSWDDKT		CQKSANVSSI		WHRNYSPRPE		SGTVSDAPQL		KENPSTVGVE
RVISTKGLNL		PRKSSIVKRP		RSAELSEDDL		LSQYSLSFTK		KTKKNSSEGN
KSLSFSEVFV		PDLVNGPTNK		KSVSTPPRTR		NKFATFLQRK		NEESGAVVVP
GTRSRFFCSS		DSTDCVSNKV		SIQPLDETAV		TDKENNLHES		EYGDQEGKRL
VDTDVARNSS		DDIPNNHIPG		DHIPDKATVF		TDEESYSFES		SKFTRTISPP
TLGTLRSCFS		WSGGLGDFSR		TPSPSPSTAL		QQFRRKSDSP		TSLPENNMSD
VSQLKSEESS		DDESHPLREE		ACSSQSQESG		EFSLQSSNAS		KLSQCSSKDS
DSEESDCNIK		LLDSQSDQTS		KLRLSHFSKK		DTPLRNKVPG		LYKSSSADSL
STTKIKPLGP		ARASGLSKKP		ASIQKRKHHN		AENKPGLQIK		LNELWKNFGF
KKDSEKLPPC		KKPLSPVRDN		IQLTPEAEED		IFNKPECGRV		QRAIFQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мейоз, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• Qiu J., Qian Y., Chen V., Guan M.-X., Shen B. (1999). Human exonuclease 1 functionally complements its yeast homologues in DNA recombination, RNA primer removal, and mutation avoidance. J. Biol. Chem. 274: 17893—17900. PMID 10364235 DOI:10.1074/jbc.274.25.17893
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee B.-I., Wilson D.M. III (1999). The RAD2 domain of human exonuclease 1 exhibits 5' to 3' exonuclease and flap structure-specific endonuclease activities. J. Biol. Chem. 274: 37763—37769. PMID 10608837 DOI:10.1074/jbc.274.53.37763
• Schmutte C., Sadoff M.M., Shim K.-S., Acharya S., Fishel R. (2001). The interaction of DNA mismatch repair proteins with human exonuclease I. J. Biol. Chem. 276: 33011—33018. PMID 11427529 DOI:10.1074/jbc.M102670200
• Genschel J., Bazemore L.R., Modrich P. (2002). Human exonuclease I is required for 5' and 3' mismatch repair. J. Biol. Chem. 277: 13302—13311. PMID 11809771 DOI:10.1074/jbc.M111854200
• Lee B.-I., Nguyen L.H., Barsky D., Fernandes M., Wilson D.M. III (2002). Molecular interactions of human Exo1 with DNA. Nucleic Acids Res. 30: 942—949. PMID 11842105 DOI:10.1093/nar/30.4.942

Див. також

• Хромосома 1