FDFT1

FDFT1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1EZF, 3ASX, 3LEE, 3Q2Z, 3Q30, 3V66, 3VJ8, 3VJ9, 3VJA, 3VJB, 3VJC, 3WC9, 3WCD, 3WCF, 3WCH, 3WCI, 3WCJ, 3WCL, 3WCM, 3WEF, 3WEG, 3WEH, 3WEI, 3WEJ, 3WEK, 3WSA
Ідентифікатори
Символи	FDFT1, DGPT, ERG9, SQS, SS, farnesyl-diphosphate farnesyltransferase 1, SQSD
Зовнішні ІД	OMIM: 184420 MGI: 102706 HomoloGene: 3281 GeneCards: FDFT1
Пов'язані генетичні захворювання
	fatty liver disease
Реагує на сполуку
	sq-109, zaragozic acid A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • каталітична активність; • GO:0048045 transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups; • farnesyl-diphosphate farnesyltransferase activity; • squalene synthase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • ендоплазматичний ретикулум; • endoplasmic reticulum membrane;
Біологічний процес	• steroid metabolic process; • sterol biosynthetic process; • lipid biosynthetic process; • lipid metabolism; • cholesterol metabolic process; • Біосинтез; • isoprenoid biosynthetic process; • обмін речовин; • steroid biosynthetic process; • cholesterol biosynthetic process; • ergosterol biosynthetic process; • farnesyl diphosphate metabolic process; • regulation of lipid metabolic process; • regulation of cholesterol biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2222
	14137
	ENSG00000079459; ENSG00000284967
	ENSMUSG00000021273
	P37268; Q6IAX1
	P53798
NM_001287742; NM_001287743; NM_001287744; NM_001287745; NM_001287747;
	NM_001287748; NM_001287749; NM_001287750; NM_001287751; NM_001287756; NM_004462
	NM_010191; NM_001360211
NP_001274671; NP_001274672; NP_001274673; NP_001274674; NP_001274676;
	NP_001274677; NP_001274678; NP_001274679; NP_001274680; NP_001274685; NP_004453; NP_001274671.1; NP_001274672.1; NP_004453.3
	NP_034321; NP_001347140
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FDFT1 (англ. Farnesyl-diphosphate farnesyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 417 амінокислот, а молекулярна маса — 48 115^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEFVKCLGHP	EEFYNLVRFR	IGGKRKVMPK	MDQDSLSSSL	KTCYKYLNQT
SRSFAAVIQA	LDGEMRNAVC	IFYLVLRALD	TLEDDMTISV	EKKVPLLHNF
HSFLYQPDWR	FMESKEKDRQ	VLEDFPTISL	EFRNLAEKYQ	TVIADICRRM
GIGMAEFLDK	HVTSEQEWDK	YCHYVAGLVG	IGLSRLFSAS	EFEDPLVGED
TERANSMGLF	LQKTNIIRDY	LEDQQGGREF	WPQEVWSRYV	KKLGDFAKPE
NIDLAVQCLN	ELITNALHHI	PDVITYLSRL	RNQSVFNFCA	IPQVMAIATL
AACYNNQQVF	KGAVKIRKGQ	AVTLMMDATN	MPAVKAIIYQ	YMEEIYHRIP
DSDPSSSKTR	QIISTIRTQN	LPNCQLISRS	HYSPIYLSFV	MLLAALSWQY
LTTLSQVTED	YVQTGEH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, біосинтез ліпідів, біосинтез холестеролу, біосинтез стероїдів, біосинтез стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном магнію, НАДФ. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Robinson G.W., Tsay Y.H., Kienzle B.K., Smith-Monroy C.A., Bishop R.W. (1993). Conservation between human and fungal squalene synthetases: similarities in structure, function, and regulation. Mol. Cell. Biol. 13: 2706—2717. PMID 8474436 DOI:10.1128/MCB.13.5.2706
Summers C., Karst F., Charles A.D. (1993). Cloning, expression and characterisation of the cDNA encoding human hepatic squalene synthase, and its relationship to phytoene synthase. Gene. 136: 185—192. PMID 8294001 DOI:10.1016/0378-1119(93)90462-C
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jiang G., McKenzie T.L., Conrad D.G., Shechter I. (1993). Transcriptional regulation by lovastatin and 25-hydroxycholesterol in HepG2 cells and molecular cloning and expression of the cDNA for the human hepatic squalene synthase. J. Biol. Chem. 268: 12818—12824. PMID 7685352

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з FDFT1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Farnesyl-diphosphate farnesyltransferase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3629 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P37268 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з FDFT1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Farnesyl-diphosphate farnesyltransferase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3629 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P37268 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

FDFT1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук