FUBP1

FUBP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1J4W, 2KXH, 4LIJ
Ідентифікатори
Символи	FUBP1, FBP, FUBP, hDH V, far upstream element binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603444 MGI: 1196294 HomoloGene: 48253 GeneCards: FUBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • single-stranded DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8880	51886
Ensembl	ENSG00000162613	ENSMUSG00000028034
UniProt	Q96AE4	Q91WJ8
RefSeq (мРНК)	NM_001303433 NM_003902 NM_001376055 NM_001376056 NM_001376057	NM_057172 NM_001355366 NM_001355367 NM_001355368 NM_001355369 NM_001355370 NM_001355371 NM_001355372 NM_001355373 NM_001355374
RefSeq (білок)	NP_001290362 NP_003893 NP_001362984 NP_001362985 NP_001362986	NP_476513 NP_001342295 NP_001342296 NP_001342297 NP_001342298 NP_001342299 NP_001342300 NP_001342301 NP_001342302 NP_001342303
Локус (UCSC)	Хр. 1: 77.94 – 77.98 Mb	Хр. 3: 151.92 – 151.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FUBP1 (англ. Far upstream element binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 644 амінокислот, а молекулярна маса — 67 560.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADYSTVPPP		SSGSAGGGGG		GGGGGGVNDA		FKDALQRARQ		IAAKIGGDAG
TSLNSNDYGY		GGQKRPLEDG		DQPDAKKVAP		QNDSFGTQLP		PMHQQQSRSV
MTEEYKVPDG		MVGFIIGRGG		EQISRIQQES		GCKIQIAPDS		GGLPERSCML
TGTPESVQSA		KRLLDQIVEK		GRPAPGFHHG		DGPGNAVQEI		MIPASKAGLV
IGKGGETIKQ		LQERAGVKMV		MIQDGPQNTG		ADKPLRITGD		PYKVQQAKEM
VLELIRDQGG		FREVRNEYGS		RIGGNEGIDV		PIPRFAVGIV		IGRNGEMIKK
IQNDAGVRIQ		FKPDDGTTPE		RIAQITGPPD		RCQHAAEIIT		DLLRSVQAGN
PGGPGPGGRG		RGRGQGNWNM		GPPGGLQEFN		FIVPTGKTGL		IIGKGGETIK
SISQQSGARI		ELQRNPPPNA		DPNMKLFTIR		GTPQQIDYAR		QLIEEKIGGP
VNPLGPPVPH		GPHGVPGPHG		PPGPPGPGTP		MGPYNPAPYN		PGPPGPAPHG
PPAPYAPQGW		GNAYPHWQQQ		APPDPAKAGT		DPNSAAWAAY		YAHYYQQQAQ
PPPAAPAGAP		TTTQTNGQGD		QQNPAPAGQV		DYTKAWEEYY		KKMGQAVPAP
TGAPPGGQPD		YSAAWAEYYR		QQAAYYAQTS		PQGMPQHPPA		PQGQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vindigni A., Ochem A., Triolo G., Falaschi A. (2001). Identification of human DNA helicase V with the far upstream element-binding protein. Nucleic Acids Res. 29: 1061—1067. PMID 11222755 DOI:10.1093/nar/29.5.1061
• Rappsilber J., Ryder U., Lamond A.I., Mann M. (2002). Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome. Genome Res. 12: 1231—1245. PMID 12176931 DOI:10.1101/gr.473902
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Braddock D.T., Louis J.M., Baber J.L., Levens D., Clore G.M. (2002). Structure and dynamics of KH domains from FBP bound to single-stranded DNA. Nature. 415: 1051—1056. PMID 11875576 DOI:10.1038/4151051a

Див. також

• Хромосома 1