GATAD2B

GATAD2B
Ідентифікатори
Символи	GATAD2B, MRD18, P66beta, p68, GATA zinc finger domain containing 2B, GANDS
Зовнішні ІД	OMIM: 614998 MGI: 2443225 HomoloGene: 32484 GeneCards: GATAD2B
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 18
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • nucleosomal DNA binding • sequence-specific DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • NuRD complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57459	229542
Ensembl	ENSG00000143614 ENSG00000261992	ENSMUSG00000042390
UniProt	Q8WXI9	Q8VHR5
RefSeq (мРНК)	NM_020699	NM_139304 NM_001379655 NM_001379656 NM_001379657
RefSeq (білок)	NP_065750	NP_647465 NP_001366584 NP_001366585 NP_001366586
Локус (UCSC)	Хр. 1: 153.79 – 153.92 Mb	Хр. 3: 90.2 – 90.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GATAD2B (англ. GATA zinc finger domain containing 2B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 65 261.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDRMTEDALR		LNLLKRSLDP		ADERDDVLAK		RLKMEGHEAM		ERLKMLALLK
RKDLANLEVP		HELPTKQDGS		GVKGYEEKLN		GNLRPHGDNR		TAGRPGKENI
NDEPVDMSAR		RSEPERGRLT		PSPDIIVLSD		NEASSPRSSS		RMEERLKAAN
LEMFKGKGIE		ERQQLIKQLR		DELRLEEARL		VLLKKLRQSQ		LQKENVVQKT
PVVQNAASIV		QPSPAHVGQQ		GLSKLPSRPG		AQGVEPQNLR		TLQGHSVIRS
ATNTTLPHML		MSQRVIAPNP		AQLQGQRGPP		KPGLVRTTTP		NMNPAINYQP
QSSSSVPCQR		TTSSAIYMNL		ASHIQPGTVN		RVSSPLPSPS		AMTDAANSQA
AAKLALRKQL		EKTLLEIPPP		KPPAPLLHFL		PSAANSEFIY		MVGLEEVVQS
VIDSQGKSCA		SLLRVEPFVC		AQCRTDFTPH		WKQEKNGKIL		CEQCMTSNQK
KALKAEHTNR		LKNAFVKALQ		QEQEIEQRLQ		QQAALSPTTA		PAVSSVSKQE
TIMRHHTLRQ		APQPQSSLQR		GIPTSARSML		SNFAQAPQLS		VPGGLLGMPG
VNIAYLNTGI		GGHKGPSLAD		RQREYLLDMI		PPRSISQSIS		GQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. (2002). Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3. J. Biol. Chem. 277: 40958—40966. PMID 12183469 DOI:10.1074/jbc.M207467200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Brackertz M., Gong Z., Leers J., Renkawitz R. (2006). p66alpha and p66beta of the Mi-2/NuRD complex mediate MBD2 and histone interaction. Nucleic Acids Res. 34: 397—406. PMID 16415179 DOI:10.1093/nar/gkj437
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 1