GCM1

GCM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ODH
Ідентифікатори
Символи	GCM1, GCMA, hGCMa, glial cells missing homolog 1, glial cells missing transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603715 MGI: 108045 HomoloGene: 2702 GeneCards: GCM1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • histone deacetylase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription regulator complex • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • anatomical structure morphogenesis • positive regulation of syncytium formation by plasma membrane fusion • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • branching involved in labyrinthine layer morphogenesis • astrocyte fate commitment • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • gliogenesis • regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development • cell differentiation involved in embryonic placenta development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8521	14531
Ensembl	ENSG00000137270	ENSMUSG00000023333
UniProt	Q9NP62	P70348
RefSeq (мРНК)	NM_003643	NM_008103
RefSeq (білок)	NP_003634	NP_032129
Локус (UCSC)	Хр. 6: 53.13 – 53.15 Mb	Хр. 9: 77.96 – 77.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GCM1 (англ. Glial cells missing homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 436 амінокислот, а молекулярна маса — 49 268.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPDDFDSED		KEILSWDIND		VKLPQNVKKT		DWFQEWPDSY		AKHIYSSEDK
NAQRHLSSWA		MRNTNNHNSR		ILKKSCLGVV		VCGRDCLAEE		GRKIYLRPAI
CDKARQKQQR		KRCPNCDGPL		KLIPCRGHGG		FPVTNFWRHD		GRFIFFQSKG
EHDHPKPETK		LEAEARRAMK		KVNTAPSSVS		LSLKGSTETR		SLPGETQSQG
SLPLTWSFQE		GVQLPGSYSG		HLIANTPQQN		SLNDCFSFSK		SYGLGGITDL
TDQTSTVDPM		KLYEKRKLSS		SRTYSSGDLL		PPSASGVYSD		HGDLQAWSKN
AALGRNHLAD		NCYSNYPFPL		TSWPCSFSPS		QNSSEPFYQQ		LPLEPPAAKT
GCPPLWPNPA		GNLYEEKVHV		DFNSYVQSPA		YHSPQEDPFL		FTYASHPHQQ
YSLPSKSSKW		DFEEEMTYLG		LDHCNNDMLL		NLCPLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Akiyama Y., Hosoya T., Poole A.M., Hotta Y. (1996). The gcm-motif: a novel DNA binding motif conserved in Drosophila and mammals. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 14912—14916. PMID 8962155 DOI:10.1073/pnas.93.25.14912
• Yamada K., Ogawa H., Honda S., Harada N., Okazaki T. (1999). A GCM motif protein is involved in placenta-specific expression of human aromatase gene. J. Biol. Chem. 274: 32279—32286. PMID 10542267 DOI:10.1074/jbc.274.45.32279
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chiang M.H., Chen L.F., Chen H. (2008). Ubiquitin-conjugating enzyme UBE2D2 is responsible for FBXW2 (F-box and WD repeat domain containing 2)-mediated human GCM1 (glial cell missing homolog 1) ubiquitination and degradation. Biol. Reprod. 79: 914—920. PMID 18703417 DOI:10.1095/biolreprod.108.071407

Див. також

• Хромосома 6