GMEB1

GMEB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OQJ
Ідентифікатори
Символи	GMEB1, P96PIF, PIF96, glucocorticoid modulatory element binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604409 MGI: 2135604 HomoloGene: 10647 GeneCards: GMEB1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10691	56809
Ensembl	ENSG00000162419	ENSMUSG00000028901
UniProt	Q9Y692	Q9JL60
RefSeq (мРНК)	NM_006582 NM_024482 NM_001319674	NM_001122992 NM_020273
RefSeq (білок)	NP_001306603 NP_006573 NP_077808	NP_001116464 NP_064669
Локус (UCSC)	Хр. 1: 28.67 – 28.72 Mb	Хр. 4: 132.22 – 132.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GMEB1 (англ. Glucocorticoid modulatory element binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 573 амінокислот, а молекулярна маса — 62 591.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MANAEVSVPV		GDVVVVPTEG		NEGENPEDTK		TQVILQLQPV		QQGLFIDGHF
YNRIYEAGSE		NNTAVVAVET		HTIHKIEEGI		DTGTIEANED		MEIAYPITCG
ESKAILLWKK		FVCPGINVKC		VKFNDQLISP		KHFVHLAGKS		TLKDWKRAIR
LGGIMLRKMM		DSGQIDFYQH		DKVCSNTCRS		TKFDLLISSA		RAPVPGQQTS
VVQTPTSADG		SITQIAISEE		SMEEAGLEWN		SALTAAVTMA		TEEGVKKDSE
EISEDTLMFW		KGIADVGLME		EVVCNIQKEI		EELLRGVQQR		LIQAPFQVTD
AAVLNNVAHT		FGLMDTVKKV		LDNRRNQVEQ		GEEQFLYTLT		DLERQLEEQK
KQGQDHRLKS		QTVQNVVLMP		VSTPKPPKRP		RLQRPASTTV		LSPSPPVQQP
QFTVISPITI		TPVGQSFSMG		NIPVATLSQG		SSPVTVHTLP		SGPQLFRYAT
VVSSAKSSSP		DTVTIHPSSS		LALLSSTAMQ		DGSTLGNMTT		MVSPVELVAM
ESGLTSAIQA		VESTSEDGQT		IIEIDPAPDP		EAEDTEGKAV		ILETELRTEE
KVVAEMEEHQ		HQVHNVEIVV		LED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Theriault J.R., Charette S.J., Lambert H., Landry J. (1999). Cloning and characterization of hGMEB1, a novel glucocorticoid modulatory element binding protein. FEBS Lett. 452: 170—176. PMID 10386584 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00634-1
• Christensen J., Cotmore S.F., Tattersall P. (1999). Two new members of the emerging KDWK family of combinatorial transcription modulators bind as a heterodimer to flexibly spaced PuCGPy half-sites. Mol. Cell. Biol. 19: 7741—7750. PMID 10523663 DOI:10.1128/MCB.19.11.7741
• Kaul S., Blackford J.A. Jr., Chen J., Ogryzko V.V., Simons S.S. Jr. (2000). Properties of the glucocorticoid modulatory element binding proteins GMEB-1 and -2: potential new modifiers of glucocorticoid receptor transactivation and members of the family of KDWK proteins. Mol. Endocrinol. 14: 1010—1027. PMID 10894151 DOI:10.1210/mend.14.7.0494
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Surdo P.L., Bottomley M.J., Sattler M., Scheffzek K. (2003). Crystal structure and nuclear magnetic resonance analyses of the SAND domain from glucocorticoid modulatory element binding protein-1 reveals deoxyribonucleic acid and zinc binding regions. Mol. Endocrinol. 17: 1283—1295. PMID 12702733 DOI:10.1210/me.2002-0409

Див. також

• Хромосома 1