GPBP1

GPBP1
Ідентифікатори
Символи	GPBP1, GPBP, SSH6, VASCULIN, GC-rich promoter binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608412 MGI: 1920524 HomoloGene: 11292 GeneCards: GPBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	65056	73274
Ensembl	ENSG00000062194	ENSMUSG00000032745
UniProt	Q86WP2	Q6NXH3
RefSeq (мРНК)	NM_001127235 NM_001127236 NM_001203246 NM_022913 NM_001331037	NM_001122963 NM_028487 NM_001361923 NM_001361924 NM_001361925 NM_001361926
RefSeq (білок)	NP_001120707 NP_001120708 NP_001190175 NP_001317966 NP_075064	NP_001116435 NP_082763 NP_001348852 NP_001348853 NP_001348854 NP_001348855
Локус (UCSC)	Хр. 5: 57.17 – 57.26 Mb	Хр. 13: 111.56 – 111.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GPBP1 (англ. GC-rich promoter binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 53 339.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQHDFAPAW		LNFPTPPSST		KSSLNFEKHS		ENFAWTENRY		DVNRRRHNSS
DGFDSAIGRP		NGGNFGRKEK		NGWRTHGRNG		TENINHRGGY		HGGSSRSRSS
IFHAGKSQGL		HENNIPDNET		GRKEDKRERK		QFEAEDFPSL		NPEYEREPNH
NKSLAAGVWE		YPPNPKSRAP		RMLVIKKGNT		KDLQLSGFPV		VGNLPSQPVK
NGTGPSVYKG		LVPKPAAPPT		KPTQWKSQTK		ENKVGTSFPH		ESTFGVGNFN
AFKSTAKNFS		PSTNSVKECN		RSNSSSPVDK		LNQQPRLTKL		TRMRTDKKSE
FLKALKRDRV		EEEHEDESRA		GSEKDDDSFN		LHNSNSTHQE		RDINRNFDEN
EIPQENGNAS		VISQQIIRSS		TFPQTDVLSS		SLEAEHRLLK		EMGWQEDSEN
DETCAPLTED		EMREFQVISE		QLQKNGLRKN		GILKNGLICD		FKFGPWKNST
FKPTTENDDT		ETSSSDTSDD		DDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5