HAVCR1

HAVCR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5DZO, 5F70
Ідентифікатори
Символи	HAVCR1, HAVCR, HAVCR-1, KIM-1, KIM1, TIM, TIM-1, TIM1, TIMD-1, TIMD1, CD365, hepatitis A virus cellular receptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606518 MGI: 2159680 HomoloGene: 134424 GeneCards: HAVCR1
Онтологія гена Молекулярна функція • virus receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • motile cilium • мембрана Біологічний процес • GO:0022415 viral process • viral entry into host cell Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26762	171283
Ensembl	ENSG00000113249	ENSMUSG00000040405
UniProt	Q96D42	Q5QNS5
RefSeq (мРНК)	NM_001099414 NM_001173393 NM_001308156 NM_012206	NM_001166631 NM_001166632 NM_134248
RefSeq (білок)	NP_001166864 NP_001295085 NP_036338	NP_001160103 NP_001160104 NP_599009
Локус (UCSC)	Хр. 5: 157.03 – 157.06 Mb	Хр. 11: 46.63 – 46.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HAVCR1 (англ. Hepatitis A virus cellular receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 38 720.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHPQVVILSL		ILHLADSVAG		SVKVGGEAGP		SVTLPCHYSG		AVTSMCWNRG
SCSLFTCQNG		IVWTNGTHVT		YRKDTRYKLL		GDLSRRDVSL		TIENTAVSDS
GVYCCRVEHR		GWFNDMKITV		SLEIVPPKVT		TTPIVTTVPT		VTTVRTSTTV
PTTTTVPTTT		VPTTMSIPTT		TTVLTTMTVS		TTTSVPTTTS		IPTTTSVPVT
TTVSTFVPPM		PLPRQNHEPV		ATSPSSPQPA		ETHPTTLQGA		IRREPTSSPL
YSYTTDGNDT		VTESSDGLWN		NNQTQLFLEH		SLLTANTTKG		IYAGVCISVL
VLLALLGVII		AKKYFFKKEV		QQLSVSFSSL		QIKALQNAVE		KEVQAEDNIY
IENSLYATD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Feigelstock D., Thompson P., Mattoo P., Zhang Y., Kaplan G.G. (1998). The human homolog of HAVcr-1 codes for a hepatitis A virus cellular receptor. J. Virol. 72: 6621—6628. PMID 9658108

Див. також

• Хромосома 5