HIRA

HIRA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2I32
Ідентифікатори
Символи	HIRA, DGCR1, TUP1, TUPLE1, histone cell cycle regulator
Зовнішні ІД	OMIM: 600237 MGI: 99430 HomoloGene: 48172 GeneCards: HIRA
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • nucleosome binding • DNA binding Клітинна компонента • PML body • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • HIR complex • центромера • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • muscle cell differentiation • anatomical structure morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • гаструляція • osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • mitotic sister chromatid segregation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7290	15260
Ensembl	ENSG00000100084	ENSMUSG00000022702
UniProt	P54198	Q61666
RefSeq (мРНК)	NM_003325	NM_001005228 NM_010435
RefSeq (білок)	NP_003316	NP_034565
Локус (UCSC)	Хр. 22: 19.33 – 19.45 Mb	Хр. 16: 18.7 – 18.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIRA (англ. Histone cell cycle regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 017 амінокислот, а молекулярна маса — 111 835.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLLKPTWVN		HNGKPIFSVD		IHPDGTKFAT		GGQGQDSGKV		VIWNMSPVLQ
EDDEKDENIP		KMLCQMDNHL		ACVNCVRWSN		SGMYLASGGD		DKLIMVWKRA
TYIGPSTVFG		SSGKLANVEQ		WRCVSILRNH		SGDVMDVAWS		PHDAWLASCS
VDNTVVIWNA		VKFPEILATL		RGHSGLVKGL		TWDPVGKYIA		SQADDRSLKV
WRTLDWQLET		SITKPFDECG		GTTHVLRLSW		SPDGHYLVSA		HAMNNSGPTA
QIIEREGWKT		NMDFVGHRKA		VTVVKFNPKI		FKKKQKNGSS		AKPSCPYCCC
AVGSKDRSLS		VWLTCLKRPL		VVIHELFDKS		IMDISWTLNG		LGILVCSMDG
SVAFLDFSQD		ELGDPLSEEE		KSRIHQSTYG		KSLAIMTEAQ		LSTAVIENPE
MLKYQRRQQQ		QQLDQKSAAT		REMGSATSVA		GVVNGESLED		IRKNLLKKQV
ETRTADGRRR		ITPLCIAQLD		TGDFSTAFFN		SIPLSGSLAG		TMLSSHSSPQ
LLPLDSSTPN		SFGASKPCTE		PVVAASARPA		GDSVNKDSMN		ATSTPAALSP
SVLTTPSKIE		PMKAFDSRFT		ERSKATPGAP		ALTSMTPTAV		ERLKEQNLVK
ELRPRDLLES		SSDSDEKVPL		AKASSLSKRK		LELEVETVEK		KKKGRPRKDS
RLMPVSLSVQ		SPAALTAEKE		AMCLSAPALA		LKLPIPSPQR		AFTLQVSSDP
SMYIEVENEV		TVVGGVKLSR		LKCNREGKEW		ETVLTSRILT		AAGSCDVVCV
ACEKRMLSVF		STCGRRLLSP		ILLPSPISTL		HCTGSYVMAL		TAAATLSVWD
VHRQVVVVKE		ESLHSILAGS		DMTVSQILLT		QHGIPVMNLS		DGKAYCFNPS
LSTWNLVSDK		QDSLAQCADF		RSSLPSQDAM		LCSGPLAIIQ		GRTSNSGRQA
ARLFSVPHVV		QQETTLAYLE		NQVAAALTLQ		SSHEYRHWLL		VYARYLVNEG
FEYRLREICK		DLLGPVHYST		GSQWESTVVG		LRKRELLKEL		LPVIGQNLRF
QRLFTECQEQ		LDILRDK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wilming L.G., Snoeren C.A.S., van Rijswijk A., Grosveld F., Meijers C. (1997). The murine homologue of HIRA, a DiGeorge syndrome candidate gene, is expressed in embryonic structures affected in human CATCH22 patients. Hum. Mol. Genet. 6: 247—258. PMID 9063745 DOI:10.1093/hmg/6.2.247
• Tagami H., Ray-Gallet D., Almouzni G., Nakatani Y. (2004). Histone H3.1 and H3.3 complexes mediate nucleosome assembly pathways dependent or independent of DNA synthesis. Cell. 116: 51—61. PMID 14718166 DOI:10.1016/S0092-8674(03)01064-X
• Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200

Див. також

• Хромосома 22