HLA-C

HLA-C
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3BZF,%%s4NT6,%%s1EFX,%%s1IM9, 1QQD
Ідентифікатори
Символи	HLA-C, D6S204, HLA-JY3, HLC-C, PSORS1, major histocompatibility complex, class I, C, MHC
Зовнішні ІД	OMIM: 142840 HomoloGene: 133080 GeneCards: HLA-C
Пов'язані генетичні захворювання
	хронічне обструктивне захворювання легень, psoriatic arthritis
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • phagocytic vesicle membrane; • комплекс Ґольджі; • early endosome membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • cell surface; • ендоплазматичний ретикулум; • MHC class I protein complex; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • екзосома; • secretory granule membrane; • recycling endosome membrane;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • процес імунної системи; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent; • type I interferon signaling pathway; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • regulation of immune response; • GO:0022415 viral process; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3107
	н/д
ENSG00000204525; ENSG00000233841; ENSG00000228299; ENSG00000225691; ENSG00000206435;
	ENSG00000237022; ENSG00000206452
	н/д
	P10321
	н/д
	NM_002117; NM_001243042
	н/д
	NP_001229971; NP_002108
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

HLA-C (англ. Major histocompatibility complex, class I, C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 40 649^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVMAPRALL	LLLSGGLALT	ETWACSHSMR	YFDTAVSRPG	RGEPRFISVG
YVDDTQFVRF	DSDAASPRGE	PRAPWVEQEG	PEYWDRETQK	YKRQAQADRV
SLRNLRGYYN	QSEDGSHTLQ	RMSGCDLGPD	GRLLRGYDQS	AYDGKDYIAL
NEDLRSWTAA	DTAAQITQRK	LEAARAAEQL	RAYLEGTCVE	WLRRYLENGK
ETLQRAEPPK	THVTHHPLSD	HEATLRCWAL	GFYPAEITLT	WQRDGEDQTQ
DTELVETRPA	GDGTFQKWAA	VVVPSGQEQR	YTCHMQHEGL	QEPLTLSWEP
SSQPTIPIMG	IVAGLAVLVV	LAVLGAVVTA	MMCRRKSSGG	KGGSCSQAAC
SNSAQGSDES	LITCKA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література[ред. | ред. код]

Vilches C., Bunce M., de Pablo R., Herrero M.J., Kreisler M. (1995). Anchored PCR cloning of the novel HLA-Cw*0704 allele detected by PCR-SSP. Tissue Antigens. 46: 19—23. PMID 7482492 DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02471.x
Cooper S.L., Adams E.J., Wells R.S., Walker C.M., Parham P. (1998). A major histocompatibility complex class I allele shared by two species of chimpanzee. Immunogenetics. 47: 212—217. PMID 9435339 DOI:10.1007/s002510050350
Baurain J.-F., Coulie P.G. (1999). Correction of HLA-Cw*0501 and identification of HLA-Cw*0711. Tissue Antigens. 53: 510—512. PMID 10372547 DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.530508.x
Steinle A., Schendel D.J. (1994). HLA class I alleles of LCL 721 and 174 x CEM.T2 (T2). Tissue Antigens. 44: 268—270. PMID 7871529 DOI:10.1111/j.1399-0039.1994.tb02394.x
van der Vlies S.A., Voorter C.E., van den Berg-Loonen E.M. (1999). There is more to HLA -C than exons 2 and 3: sequencing exons 1, 4 and 5. Tissue Antigens. 54: 169—177. PMID 10488744 DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.540208.x
Pohla H., Kuon W., Tabaczewski P., Doerner C., Weiss E.H. (1989). Allelic variation in HLA-B and HLA-C sequences and the evolution of the HLA-B alleles. Immunogenetics. 29: 297—307. PMID 2714852 DOI:10.1007/BF00352839