HLTF

HLTF
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MZN, 4HRE, 4HRH, 4S0N, 4XZF, 4XZG, 5BNH, 5K5F
Ідентифікатори
Символи	HLTF, HIP116, HIP116A, HLTF1, RNF80, SMARCA3, SNF2L3, ZBU1, helicase-like transcription factor, helicase like transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 603257 MGI: 1196437 HomoloGene: 30136 GeneCards: HLTF
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0102490, GO:0102491, GO:0102489, GO:0102488, GO:0102487, GO:0102486, GO:0102485 hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • nucleic acid binding • hydrolase activity • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • RNA binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • ядерце • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • обмін речовин • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6596	20585
Ensembl	ENSG00000071794	ENSMUSG00000002428
UniProt	Q14527	Q6PCN7
RefSeq (мРНК)	NM_003071 NM_139048 NM_001318934 NM_001318935	NM_009210 NM_144959 NM_001355097
RefSeq (білок)	NP_001305863 NP_001305864 NP_003062 NP_620636	NP_033236 NP_001342026
Локус (UCSC)	Хр. 3: 149.03 – 149.09 Mb	Хр. 3: 20.11 – 20.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLTF (англ. Helicase like transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 009 амінокислот, а молекулярна маса — 113 929.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSWMFKRDPV		WKYLQTVQYG		VHGNFPRLSY		PTFFPRFEFQ		DVIPPDDFLT
SDEEVDSVLF		GSLRGHVVGL		RYYTGVVNNN		EMVALQRDPN		NPYDKNAIKV
NNVNGNQVGH		LKKELAGALA		YIMDNKLAQI		EGVVPFGANN		AFTMPLHMTF
WGKEENRKAV		SDQLKKHGFK		LGPAPKTLGF		NLESGWGSGR		AGPSYSMPVH
AAVQMTTEQL		KTEFDKLFED		LKEDDKTHEM		EPAEAIETPL		LPHQKQALAW
MVSRENSKEL		PPFWEQRNDL		YYNTITNFSE		KDRPENVHGG		ILADDMGLGK
TLTAIAVILT		NFHDGRPLPI		ERVKKNLLKK		EYNVNDDSMK		LGGNNTSEKA
DGLSKDASRC		SEQPSISDIK		EKSKFRMSEL		SSSRPKRRKT		AVQYIESSDS
EEIETSELPQ		KMKGKLKNVQ		SETKGRAKAG		SSKVIEDVAF		ACALTSSVPT
TKKKMLKKGA		CAVEGSKKTD		VEERPRTTLI		ICPLSVLSNW		IDQFGQHIKS
DVHLNFYVYY		GPDRIREPAL		LSKQDIVLTT		YNILTHDYGT		KGDSPLHSIR
WLRVILDEGH		AIRNPNAQQT		KAVLDLESER		RWVLTGTPIQ		NSLKDLWSLL
SFLKLKPFID		REWWHRTIQR		PVTMGDEGGL		RRLQSLIKNI		TLRRTKTSKI
KGKPVLELPE		RKVFIQHITL		SDEERKIYQS		VKNEGRATIG		RYFNEGTVLA
HYADVLGLLL		RLRQICCHTY		LLTNAVSSNG		PSGNDTPEEL		RKKLIRKMKL
ILSSGSDEEC		AICLDSLTVP		VITHCAHVFC		KPCICQVIQN		EQPHAKCPLC
RNDIHEDNLL		ECPPEELARD		SEKKSDMEWT		SSSKINALMH		ALTDLRKKNP
NIKSLVVSQF		TTFLSLIEIP		LKASGFVFTR		LDGSMAQKKR		VESIQCFQNT
EAGSPTIMLL		SLKAGGVGLN		LSAASRVFLM		DPAWNPAAED		QCFDRCHRLG
QKQEVIITKF		IVKDSVEENM		LKIQNKKREL		AAGAFGTKKP		NADEMKQAKI
NEIRTLIDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз, активаторів, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, убіквітинування білків, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Sheridan P.L., Schorpp M., Voz M.L., Jones K.A. (1995). Cloning of an SNF2/SWI2-related protein that binds specifically to the SPH motifs of the SV40 enhancer and to the HIV-1 promoter. J. Biol. Chem. 270: 4575—4587. PMID 7876228 DOI:10.1074/jbc.270.9.4575
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ding H., Benotmane A.M., Suske G., Collen D., Belayew A. (1999). Functional interactions between Sp1 or Sp3 and the helicase-like transcription factor mediate basal expression from the human plasminogen activator inhibitor-1 gene. J. Biol. Chem. 274: 19573—19580. PMID 10391891 DOI:10.1074/jbc.274.28.19573
• Helmer R.A., Dertien J.S., Chilton B.S. (2011). Prolactin induces Jak2 phosphorylation of RUSHY195. Mol. Cell. Endocrinol. 338: 79—83. PMID 21457752 DOI:10.1016/j.mce.2011.03.009
• Descheemaeker K. (1993). On the regulation of the plasminogen activator inhibitor-1 gene expression. Verh. K. Acad. Geneeskd. Belg. 55: 225—264. PMID 8342330

Див. також

• Хромосома 3