HPSE

HPSE
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5E97, 5E9B, 5E8M, 5E98, 5E9C
Ідентифікатори
Символи	HPSE, HPA, HPA1, HPR1, HPSE1, HSE1, heparanase
Зовнішні ІД	OMIM: 604724 MGI: 1343124 HomoloGene: 68528 GeneCards: HPSE
Онтологія гена Молекулярна функція • protein dimerization activity • heparanase activity • beta-glucuronidase activity • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syndecan binding • hydrolase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • нуклеоплазма • lysosomal membrane • lysosomal lumen • membrane raft • лізосома • клітинне ядро • extracellular region • specific granule lumen • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • positive regulation of osteoblast proliferation • positive regulation of protein kinase B signaling • heparan sulfate proteoglycan catabolic process • regulation of hair follicle development • positive regulation of hair follicle development • Загоєння ран • vascular wound healing • адгезія клітин • positive regulation of blood coagulation • proteoglycan metabolic process • glycosaminoglycan catabolic process • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • cell-matrix adhesion • angiogenesis involved in wound healing • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10855	15442
Ensembl	ENSG00000173083	ENSMUSG00000035273
UniProt	Q9Y251	Q6YGZ1
RefSeq (мРНК)	NM_006665 NM_001098540 NM_001166498 NM_001199830	NM_152803
RefSeq (білок)	NP_001092010 NP_001159970 NP_001186759 NP_006656	NP_690016
Локус (UCSC)	Хр. 4: 83.29 – 83.34 Mb	Хр. 5: 100.83 – 100.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HPSE (англ. Heparanase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 543 амінокислот, а молекулярна маса — 61 149.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLRSKPALP		PPLMLLLLGP		LGPLSPGALP		RPAQAQDVVD		LDFFTQEPLH
LVSPSFLSVT		IDANLATDPR		FLILLGSPKL		RTLARGLSPA		YLRFGGTKTD
FLIFDPKKES		TFEERSYWQS		QVNQDICKYG		SIPPDVEEKL		RLEWPYQEQL
LLREHYQKKF		KNSTYSRSSV		DVLYTFANCS		GLDLIFGLNA		LLRTADLQWN
SSNAQLLLDY		CSSKGYNISW		ELGNEPNSFL		KKADIFINGS		QLGEDFIQLH
KLLRKSTFKN		AKLYGPDVGQ		PRRKTAKMLK		SFLKAGGEVI		DSVTWHHYYL
NGRTATKEDF		LNPDVLDIFI		SSVQKVFQVV		ESTRPGKKVW		LGETSSAYGG
GAPLLSDTFA		AGFMWLDKLG		LSARMGIEVV		MRQVFFGAGN		YHLVDENFDP
LPDYWLSLLF		KKLVGTKVLM		ASVQGSKRRK		LRVYLHCTNT		DNPRYKEGDL
TLYAINLHNV		TKYLRLPYPF		SNKQVDKYLL		RPLGPHGLLS		KSVQLNGLTL
KMVDDQTLPP		LMEKPLRPGS		SLGLPAFSYS		FFVIRNAKVA		ACI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у ядрі, мембрані, лізосомі. Також секретований назовні.

Література

• Toyoshima M., Nakajima M. (1999). Human heparanase. Purification, characterization, cloning, and expression. J. Biol. Chem. 274: 24153—24160. PMID 10446189 DOI:10.1074/jbc.274.34.24153
• Dempsey L.A., Plummer T.B., Coombes S.L., Platt J.L. (2000). Heparanase expression in invasive trophoblasts and acute vascular damage. Glycobiology. 10: 467—475. PMID 10764835 DOI:10.1093/glycob/10.5.467
• Nasser N.J., Avivi A., Shushy M., Vlodavsky I., Nevo E. (2007). Cloning, expression, and characterization of an alternatively spliced variant of human heparanase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 354: 33—38. PMID 17208203 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.12.189
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Levy-Adam F., Miao H.Q., Heinrikson R.L., Vlodavsky I., Ilan N. (2003). Heterodimer formation is essential for heparanase enzymatic activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 308: 885—891. PMID 12927802 DOI:10.1016/S0006-291X(03)01478-5
• Simizu S., Ishida K., Wierzba M.K., Osada H. (2004). Secretion of heparanase protein is regulated by glycosylation in human tumor cell lines. J. Biol. Chem. 279: 2697—2703. PMID 14573609 DOI:10.1074/jbc.M300541200

Див. також

• Хромосома 4