IFIT1

IFIT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4HOU
Ідентифікатори
Символи	IFIT1, C56, G10P1, IFI-56, IFI-56K, IFI56, IFIT-1, IFNAI1, ISG56, P56, RNM561, interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1
Зовнішні ІД	OMIM: 147690 MGI: 2148249 HomoloGene: 78213 GeneCards: IFIT1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • host cell • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of helicase activity • response to virus • positive regulation of viral genome replication • negative regulation of viral genome replication • negative regulation of defense response to virus by host • cellular response to type I interferon • GO:0022415 viral process • intracellular transport of viral protein in host cell • negative regulation of protein binding • type I interferon signaling pathway • вроджений імунітет • regulation of defense response to virus • cellular response to exogenous dsRNA • процес імунної системи • defense response to virus • response to bacterium • cellular response to interferon-beta Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3434	112419
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000067297
UniProt	P09914	Q3U687
RefSeq (мРНК)	NM_001548 NM_001270927 NM_001270928 NM_001270929 NM_001270930	NM_053217 NM_001362130
RefSeq (білок)	NP_001257856 NP_001257857 NP_001257858 NP_001257859 NP_001539	NP_444447 NP_001349059
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 19: 34.59 – 34.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IFIT1 (англ. Interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478 амінокислот, а молекулярна маса — 55 360.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTNGDDHQV		KDSLEQLRCH		FTWELSIDDD		EMPDLENRVL		DQIEFLDTKY
SVGIHNLLAY		VKHLKGQNEE		ALKSLKEAEN		LMQEEHDNQA		NVRSLVTWGN
FAWMYYHMGR		LAEAQTYLDK		VENICKKLSN		PFRYRMECPE		IDCEEGWALL
KCGGKNYERA		KACFEKVLEV		DPENPESSAG		YAISAYRLDG		FKLATKNHKP
FSLLPLRQAV		RLNPDNGYIK		VLLALKLQDE		GQEAEGEKYI		EEALANMSSQ
TYVFRYAAKF		YRRKGSVDKA		LELLKKALQE		TPTSVLLHHQ		IGLCYKAQMI
QIKEATKGQP		RGQNREKLDK		MIRSAIFHFE		SAVEKKPTFE		VAHLDLARMY
IEAGNHRKAE		ENFQKLLCMK		PVVEETMQDI		HFHYGRFQEF		QKKSDVNAII
HYLKAIKIEQ		ASLTRDKSIN		SLKKLVLRKL		RRKALDLESL		SLLGFVYKLE
GNMNEALEYY		ERALRLAADF		ENSVRQGP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chebath J., Merlin G., Metz R., Benech P., Revel M. (1983). Interferon-induced 56,000 Mr protein and its mRNA in human cells: molecular cloning and partial sequence of the cDNA. Nucleic Acids Res. 11: 1213—1226. PMID 6186990 DOI:10.1093/nar/11.5.1213
• Wathelet M.G., Clauss I.M., Nols C.B., Content J., Huez G.A. (1987). New inducers revealed by the promoter sequence analysis of two interferon-activated human genes. Eur. J. Biochem. 169: 313—321. PMID 3121313 DOI:10.1111/j.1432-1033.1987.tb13614.x
• Wathelet M.G., Clauss I.M., Content J., Huez G.A. (1988). The IFI-56K and IFI-54K interferon-inducible human genes belong to the same gene family. FEBS Lett. 231: 164—171. PMID 3360121 DOI:10.1016/0014-5793(88)80724-5
• Zhao C., Denison C., Huibregtse J.M., Gygi S.P., Krug R.M. (2005). Human ISG15 conjugation targets both IFN-induced and constitutively expressed proteins functioning in diverse cellular pathways. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 10200—10205. PMID 16009940 DOI:10.1073/pnas.0504754102
• Terenzi F., Pal S., Sen G.C. (2005). Induction and mode of action of the viral stress-inducible murine proteins, P56 and P54. Virology. 340: 116—124. PMID 16023166 DOI:10.1016/j.virol.2005.06.011

Див. також

• Хромосома 10