IFT88

IFT88
Ідентифікатори
Символи	IFT88, D13S1056E, DAF19, TG737, TTC10, hTg737, intraflagellar transport 88
Зовнішні ІД	OMIM: 600595 MGI: 98715 HomoloGene: 4761 GeneCards: IFT88
Пов'язані генетичні захворювання
біполярний афективний розлад, шизофренія, депресія клінічна
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinesin binding Клітинна компонента • intraciliary transport particle B • цитоплазма • cell projection • ciliary tip • motile cilium • цитоскелет • Центріоль • війка • ciliary basal body • центросома • sperm flagellum • ciliary base • non-motile cilium • центр організації мікротрубочок Біологічний процес • regulation of cilium assembly • regulation of autophagosome assembly • cilium assembly • cell projection organization • intraciliary transport involved in cilium assembly • розвиток нирки • inner ear receptor cell stereocilium organization • non-motile cilium assembly • intraciliary transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8100	21821
Ensembl	ENSG00000032742	ENSMUSG00000040040
UniProt	Q13099	Q61371
RefSeq (мРНК)	NM_006531 NM_175605 NM_001318491 NM_001318493 NM_001353565 NM_001353566 NM_001353567 NM_001353568 NM_001353569 NM_001353570 NM_001353571 NM_001353572 NM_001353573 NM_001353574 NM_001353575 NM_001353576 NM_001353577 NM_001353578 NM_001353579	NM_009376
RefSeq (білок)	NP_001305420 NP_001305422 NP_006522 NP_783195 NP_001340494 NP_001340495 NP_001340496 NP_001340497 NP_001340498 NP_001340499 NP_001340500 NP_001340501 NP_001340502 NP_001340503 NP_001340504 NP_001340505 NP_001340506 NP_001340507 NP_001340508	NP_033402 NP_001391322 NP_001391323 NP_001391324 NP_001391325 NP_001391326
Локус (UCSC)	Хр. 13: 20.57 – 20.69 Mb	Хр. 14: 57.66 – 57.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IFT88 (англ. Intraflagellar transport 88) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 833 амінокислот, а молекулярна маса — 94 270.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKFTNTKVQM		MQNVHLAPET		DEDDLYSGYN		DYNPIYDIEE		LENDAAFQQA
VRTSHGRRPP		ITAKISSTAV		TRPIATGYGS		KTSLASSIGR		PMTGAIQDGV
TRPMTAVRAA		GFTKAALRGS		AFDPLSQSRG		PASPLEAKKK		DSPEEKIKQL
EKEVNELVEE		SCIANSCGDL		KLALEKAKDA		GRKERVLVRQ		REQVTTPENI
NLDLTYSVLF		NLASQYSVNE		MYAEALNTYQ		VIVKNKMFSN		AGILKMNMGN
IYLKQRNYSK		AIKFYRMALD		QVPSVNKQMR		IKIMQNIGVT		FIQAGQYSDA
INSYEHIMSM		APNLKAGYNL		TICYFAIGDR		EKMKKAFQKL		ITVPLEIDED
KYISPSDDPH		TNLVTEAIKN		DHLRQMERER		KAMAEKYIMT		SAKLIAPVIE
TSFAAGYDWC		VEVVKASQYV		ELANDLEINK		AVTYLRQKDY		NQAVEILKVL
EKKDSRVKSA		AATNLSALYY		MGKDFAQASS		YADIAVNSDR		YNPAALTNKG
NTVFANGDYE		KAAEFYKEAL		RNDSSCTEAL		YNIGLTYEKL		NRLDEALDCF
LKLHAILRNS		AEVLYQIANI		YELMENPSQA		IEWLMQVVSV		IPTDPQVLSK
LGELYDREGD		KSQAFQYYYE		SYRYFPCNIE		VIEWLGAYYI		DTQFWEKAIQ
YFERASLIQP		TQVKWQLMVA		SCFRRSGNYQ		KALDTYKDTH		RKFPENVECL
RFLVRLCTDL		GLKDAQEYAR		KLKRLEKMKE		IREQRIKSGR		DGSGGSRGKR
EGSASGDSGQ		NYSASSKGER		LSARLRALPG		TNEPYESSSN		KEIDASYVDP
LGPQIERPKT		AAKKRIDEDD		FADEELGDDL		LPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13