IKBKE

IKBKE
Ідентифікатори
Символи	IKBKE, IKK-E, IKK-i, IKKE, IKKI, inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase epsilon, inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit epsilon
Зовнішні ІД	OMIM: 605048 MGI: 1929612 HomoloGene: 23168 GeneCards: IKBKE
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • IkappaB kinase activity • nucleotide binding • K48-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • NF-kappaB-inducing kinase activity • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • protein kinase activity • protein phosphatase binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • PML body • мітохондріальна мембрана • endosome membrane • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • cellular response to virus • фосфорилювання • I-kappaB phosphorylation • response to interferon-beta • cellular response to DNA damage stimulus • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • protein phosphorylation • response to type I interferon • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of type I interferon production • protein homooligomerization • NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of lipid storage • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9641	56489
Ensembl	ENSG00000263528	ENSMUSG00000042349
UniProt	Q14164	Q9R0T8
RefSeq (мРНК)	NM_001193321 NM_001193322 NM_014002	NM_019777
RefSeq (білок)	NP_001180250 NP_001180251 NP_054721	NP_062751
Локус (UCSC)	Хр. 1: 206.47 – 206.5 Mb	Хр. 1: 131.18 – 131.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IKBKE (англ. Inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit epsilon) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 716 амінокислот, а молекулярна маса — 80 462.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQSTANYLWH		TDDLLGQGAT		ASVYKARNKK		SGELVAVKVF		NTTSYLRPRE
VQVREFEVLR		KLNHQNIVKL		FAVEETGGSR		QKVLVMEYCS		SGSLLSVLES
PENAFGLPED		EFLVVLRCVV		AGMNHLRENG		IVHRDIKPGN		IMRLVGEEGQ
SIYKLTDFGA		ARELDDDEKF		VSVYGTEEYL		HPDMYERAVL		RKPQQKAFGV
TVDLWSIGVT		LYHAATGSLP		FIPFGGPRRN		KEIMYRITTE		KPAGAIAGAQ
RRENGPLEWS		YTLPITCQLS		LGLQSQLVPI		LANILEVEQA		KCWGFDQFFA
ETSDILQRVV		VHVFSLSQAV		LHHIYIHAHN		TIAIFQEAVH		KQTSVAPRHQ
EYLFEGHLCV		LEPSVSAQHI		AHTTASSPLT		LFSTAIPKGL		AFRDPALDVP
KFVPKVDLQA		DYNTAKGVLG		AGYQALRLAR		ALLDGQELMF		RGLHWVMEVL
QATCRRTLEV		ARTSLLYLSS		SLGTERFSSV		AGTPEIQELK		AAAELRSRLR
TLAEVLSRCS		QNITETQESL		SSLNRELVKS		RDQVHEDRSI		QQIQCCLDKM
NFIYKQFKKS		RMRPGLGYNE		EQIHKLDKVN		FSHLAKRLLQ		VFQEECVQKY
QASLVTHGKR		MRVVHETRNH		LRLVGCSVAA		CNTEAQGVQE		SLSKLLEELS
HQLLQDRAKG		AQASPPPIAP		YPSPTRKDLL		LHMQELCEGM		KLLASDLLDN
NRIIERLNRV		PAPPDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Peters R.T., Liao S.-M., Maniatis T. (2000). IKK epsilon is part of a novel PMA-inducible IkappaB kinase complex. Mol. Cell. 5: 513—522. PMID 10882136 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80445-1
• Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ryzhakov G., Randow F. (2007). SINTBAD, a novel component of innate antiviral immunity, shares a TBK1-binding domain with NAP1 and TANK. EMBO J. 26: 3180—3190. PMID 17568778 DOI:10.1038/sj.emboj.7601743
• Schroder M., Baran M., Bowie A.G. (2008). Viral targeting of DEAD box protein 3 reveals its role in TBK1/IKKepsilon-mediated IRF activation. EMBO J. 27: 2147—2157. PMID 18636090 DOI:10.1038/emboj.2008.143
• Prins K.C., Cardenas W.B., Basler C.F. (2009). Ebola virus protein VP35 impairs the function of interferon regulatory factor-activating kinases IKKepsilon and TBK-1. J. Virol. 83: 3069—3077. PMID 19153231 DOI:10.1128/JVI.01875-08

Див. також

• Хромосома 1