IRF2BP2

IRF2BP2
Ідентифікатори
Символи	IRF2BP2, interferon regulatory factor 2 binding protein 2, CVID14
Зовнішні ІД	OMIM: 615332 MGI: 2443921 HomoloGene: 34290 GeneCards: IRF2BP2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • immature B cell differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	359948	270110
Ensembl	ENSG00000168264	ENSMUSG00000051495
UniProt	Q7Z5L9	E9Q1P8
RefSeq (мРНК)	NM_182972 NM_001077397	NM_001164598
RefSeq (білок)	NP_001070865 NP_892017	NP_001158070
Локус (UCSC)	Хр. 1: 234.6 – 234.61 Mb	Хр. 8: 127.32 – 127.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRF2BP2 (англ. Interferon regulatory factor 2 binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 587 амінокислот, а молекулярна маса — 61 025.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAVAVAAA		SRRQSCYLCD		LPRMPWAMIW		DFTEPVCRGC		VNYEGADRVE
FVIETARQLK		RAHGCFPEGR		SPPGAAASAA		AKPPPLSAKD		ILLQQQQQLG
HGGPEAAPRA		PQALERYPLA		AAAERPPRLG		SDFGSSRPAA		SLAQPPTPQP
PPVNGILVPN		GFSKLEEPPE		LNRQSPNPRR		GHAVPPTLVP		LMNGSATPLP
TALGLGGRAA		ASLAAVSGTA		AASLGSAQPT		DLGAHKRPAS		VSSSAAVEHE
QREAAAKEKQ		PPPPAHRGPA		DSLSTAAGAA		ELSAEGAGKS		RGSGEQDWVN
RPKTVRDTLL		ALHQHGHSGP		FESKFKKEPA		LTAGRLLGFE		ANGANGSKAV
ARTARKRKPS		PEPEGEVGPP		KINGEAQPWL		STSTEGLKIP		MTPTSSFVSP
PPPTASPHSN		RTTPPEAAQN		GQSPMAALIL		VADNAGGSHA		SKDANQVHST
TRRNSNSPPS		PSSMNQRRLG		PREVGGQGAG		NTGGLEPVHP		ASLPDSSLAT
SAPLCCTLCH		ERLEDTHFVQ		CPSVPSHKFC		FPCSRQSIKQ		QGASGEVYCP
SGEKCPLVGS		NVPWAFMQGE		IATILAGDVK		VKKERDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Childs K.S., Goodbourn S. (2003). Identification of novel co-repressor molecules for interferon regulatory factor-2. Nucleic Acids Res. 31: 3016—3026. PMID 12799427 DOI:10.1093/nar/gkg431
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carneiro F.R., Ramalho-Oliveira R., Mognol G.P., Viola J.P. (2011). Interferon regulatory factor 2 binding protein 2 is a new NFAT1 partner and represses its transcriptional activity. Mol. Cell. Biol. 31: 2889—2901. PMID 21576369 DOI:10.1128/MCB.00974-10

Див. також

• Хромосома 1